RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 TEX101Q9BY14 249 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 RNF215Q9Y6U7 377 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 LAMA5O15230 3695 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 NOBOXO60393 691 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CES1P23141 567 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 UGT1A5P35504 534 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 MMRN1Q13201 1228 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 Q6ZVL8 140 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 SPRED1Q7Z699 444 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CMKLR1Q99788 373 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PISDQ9UG56 409 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 LCMT1Q9UIC8 334 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.813e-23■□□□□ 10.8
ACTB-212ENST00000484841 ATRXP46100 2492 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PMS2P1A4D2B8 440 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PYGLP06737 847 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 LHCGRP22888 699 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 SLC5A2P31639 672 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 SKOR1P84550 965 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CFHR1Q03591 330 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PDK2Q15119 407 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PHF19Q5T6S3 580 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PIM3Q86V86 326 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PELI3Q8N2H9 469 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 TEX26Q8N6G2 289 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 GPBAR1Q8TDU6 330 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 IFNKQ9P0W0 207 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 SUFUQ9UMX1 484 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 LOXL2Q9Y4K0 774 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CEACAM5P06731 702 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 KRT7P08729 469 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CD48P09326 243 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ZNF30P17039 623 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 TEAD1P28347 426 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PBX1P40424 430 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 GALNT2Q10471 571 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 DOK6Q6PKX4 331 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 AP2M1Q96CW1 435 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 WBP1Q96G27 269 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CDH19Q9H159 772 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 DEF6Q9H4E7 631 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.819e-11■□□□□ 11.3
ACTB-212ENST00000484841 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 TAAR2Q9P1P5 351 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CD84Q9UIB8 345 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 UNC13CQ8NB66 2214 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 AGRPO00253 132 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 MFSD11O43934 449 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CPNE6O95741 557 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 IVLP07476 585 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 H2AFZP0C0S5 128 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 HGFP14210 728 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 MX2P20592 715 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CCNCP24863 283 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ALDH4A1P30038 563 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 DPTQ07507 201 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CLN3Q13286 438 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 DPYSL3Q14195 570 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 AMZ1Q400G9 498 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 TMEM164Q5U3C3 297 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 LRRC66Q68CR7 880 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 SLC30A9Q6PML9 568 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 H2AFVQ71UI9 128 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ZNF605Q86T29 641 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PIH1D2Q8WWB5 315 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ZNF670Q9BS34 389 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 AMACRQ9UHK6 382 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PPIL1Q9Y3C6 166 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 A0A0J9YYE9 177 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 K7ENP7 123 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 MATN3O15232 486 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 TRBC1P01850 177 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 FGF1P05230 155 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PDHA1P08559 390 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 IL4RP24394 825 aa20.09■□□□□ 0.81
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