RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474088.1

PKD1-211, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 5

Gene PKD1, Length 923 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-211ENST00000474088 NR1I3Q14994 352 aa24.76■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 PTPRRQ15256 657 aa24.76■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 PIM3Q86V86 326 aa24.76■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 TEKT4Q8WW24 435 aa24.76■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 SEMA6CQ9H3T2 930 aa24.76■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 PCDH18Q9HCL0 1135 aa24.76■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 TAAR2Q9P1P5 351 aa24.76■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 SUFUQ9UMX1 484 aa24.76■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 PPIL1Q9Y3C6 166 aa24.76■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa24.75■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 KALRNO60229 2985 aa24.75■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 PRAMEF10O60809 474 aa24.75■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 CPNE6O95741 557 aa24.75■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 AK4P27144 223 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 TEAD1P28347 426 aa24.75■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 SERPINB6P35237 376 aa24.75■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 PHF19Q5T6S3 580 aa24.75■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 ARMC12Q5T9G4 340 aa24.75■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 ZNF438Q7Z4V0 828 aa24.75■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 TSPAN33Q86UF1 283 aa24.75■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 PIH1D2Q8WWB5 315 aa24.75■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 USP7Q93009 1102 aa24.75■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 RDH14Q9HBH5 336 aa24.75■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 GOLGA6CA6NDK9 693 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 GOLGA6BA6NDN3 693 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 RHPN2P1A8MT19 583 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 ECEL1O95672 775 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 GOLGA6DP0CG33 693 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 ALDH4A1P30038 563 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 POLD2P49005 469 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 ZNF165P49910 485 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 MAPK10P53779 464 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 OR1D5P58170 312 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 AMZ1Q400G9 498 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 MAP9Q49MG5 647 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 FIGNQ5HY92 759 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 HGSNATQ68CP4 663 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 RAET1GQ6H3X3 334 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 USP53Q70EK8 1073 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 SEPT10Q9P0V9 454 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 ST14Q9Y5Y6 855 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 SCN8AQ9UQD0 1980 aa24.74■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 IVLP07476 585 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 CTPS1P17812 591 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 CTBSQ01459 385 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 DPTQ07507 201 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 NR1D2Q14995 579 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 C16orf72Q14CZ0 275 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 USP45Q70EL2 814 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 ZFAND4Q86XD8 727 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 LRRC49Q8IUZ0 686 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 TEX26Q8N6G2 289 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 NIPA2Q8N8Q9 360 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 SGF29Q96ES7 293 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 BTBD6Q96KE9 485 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 THAP2Q9H0W7 228 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 NT5MQ9NPB1 228 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 FOXJ2Q9P0K8 574 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 IP6K2Q9UHH9 426 aa24.73■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 UNC13CQ8NB66 2214 aa24.72■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 A0A0U1RQS6 177 aa24.72■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 C9orf172C9J069 976 aa24.72■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 ZW10O43264 779 aa24.72■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 SERPINC1P01008 464 aa24.72■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 PDHA1P08559 390 aa24.72■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 IL4RP24394 825 aa24.72■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 ADCY8P40145 1251 aa24.72■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 SLC30A9Q6PML9 568 aa24.72■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 RFLNAQ6ZTI6 216 aa24.72■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 NAGSQ8N159 534 aa24.72■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 SEMA3CQ99985 751 aa24.72■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 B3GNT4Q9C0J1 378 aa24.72■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 ATMQ13315 3056 aa24.71■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 FZD6O60353 706 aa24.71■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 CD1CP29017 333 aa24.71■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 GPR1P46091 355 aa24.71■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 ITKQ08881 620 aa24.71■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 PEX6Q13608 980 aa24.71■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 KRT81Q14533 505 aa24.71■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 IQCB1Q15051 598 aa24.71■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 LINC00303Q3SY05 128 aa24.71■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 MANEAQ5SRI9 462 aa24.71■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 NDUFAF2Q8N183 169 aa24.71■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 EXD3Q8N9H8 876 aa24.71■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 PATE1Q8WXA2 126 aa24.71■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 NUDT22Q9BRQ3 303 aa24.71■■□□□ 1.55
PKD1-211ENST00000474088 ABCG8Q9H221 673 aa24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms