RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PIH1D2Q8WWB5 315 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PTERQ96BW5 349 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ECHDC3Q96DC8 303 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 L3HYPDHQ96EM0 354 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ELMO2Q96JJ3 720 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 BIRC8Q96P09 236 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 LYSMD1Q96S90 227 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ATOH8Q96SQ7 321 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 YME1L1Q96TA2 773 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TCF12Q99081 682 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 NDNQ99608 321 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 BTBD10Q9BSF8 475 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SPON2Q9BUD6 331 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TUBB6Q9BUF5 446 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SLC46A2Q9BY10 475 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 P2RY12Q9H244 342 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf21Q9H246 121 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 GSTO2Q9H4Y5 243 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 FAM96AQ9H5X1 160 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TASP1Q9H6P5 420 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SMPD4Q9NXE4 827 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 IL17CQ9P0M4 197 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ARMCX1Q9P291 453 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 TLK1Q9UKI8 766 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 IKZF3Q9UKT9 509 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 VWA7Q9Y334 891 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 PPIL1Q9Y3C6 166 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 RAI2Q9Y5P3 530 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 ST14Q9Y5Y6 855 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC189A1A4V9 331 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 LCHNA4D1U4 455 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 NEMP2A6NFY4 417 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 HIDE1A8MVS5 230 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD66B4E2M5 251 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 K7ERQ8 282 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TNFRSF10AO00220 468 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CBX4O00257 560 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 LEFTY2O00292 366 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SDHDO14521 159 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 HGSO14964 777 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SLC22A2O15244 555 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 HDAC3O15379 428 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 BUD23O43709 281 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 GDF9O60383 454 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 MAGEC1O60732 1142 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC22O60826 627 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SOCS5O75159 536 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PGLSO95336 258 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PIGNO95427 931 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CRTAMO95727 393 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 C8AP07357 584 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA31D3P0C874 917 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PRSS56P0CW18 603 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CD1EP15812 388 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CD1DP15813 335 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RAG1P15918 1043 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CD70P32970 193 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CA5AP35218 305 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 BMPR1AP36894 532 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 GLRBP48167 497 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CCNG1P51959 295 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 NAGLUP54802 743 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP8P85298 464 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SATB1Q01826 763 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ITKQ08881 620 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 LMAN2Q12907 356 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 USP4Q13107 963 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PRKAA1Q13131 559 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 NAA25Q14CX7 972 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PTPRRQ15256 657 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHG6Q3KR16 790 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 UGT3A2Q3SY77 523 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CTSL3PQ5NE16 218 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SH2D4BQ5SQS7 431 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 WASHC2DQ5SRD0 308 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 WLSQ5T9L3 541 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF697Q5TEC3 545 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 IL31Q6EBC2 164 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 MRNIPQ6NTE8 343 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 AFTPHQ6ULP2 937 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 LINGO4Q6UY18 593 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC149Q6ZUS6 474 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 FRMD7Q6ZUT3 714 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CHSY3Q70JA7 882 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 OTOP2Q7RTS6 562 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms