RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 ANKRD66B4E2M5 251 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 PJA2O43164 708 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 MTSS1O43312 755 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 CAPNS1P04632 268 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 COPS2P61201 443 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.275e-6■□□□□ 11.3
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PTPN4-208ENST00000460289 PPP2R5EQ16537 467 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 CDKN3Q16667 212 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 RAET1GQ6H3X3 334 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 KIAA1328Q86T90 577 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 HEATR4Q86WZ0 1026 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 NRSN1Q8IZ57 195 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 PELI3Q8N2H9 469 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 IFI44Q8TCB0 444 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 OR1E3Q8WZA6 343 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 CEP41Q9BYV8 373 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPN4-208ENST00000460289 CPED1A4D0V7 1026 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 OPA1O60313 960 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 PYGLP06737 847 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 GPR1P46091 355 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 MARCKSL1P49006 195 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF765Q7L2R6 523 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 KRT35Q92764 455 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 AP2M1Q96CW1 435 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 PDXPQ96GD0 296 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 TEKT5Q96M29 485 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 SMIM14Q96QK8 99 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 ABCG8Q9H221 673 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 FGF22Q9HCT0 170 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 MOSPD1Q9UJG1 213 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 A0A0U1RQS6 177 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 CCDC66A2RUB6 948 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 CLDN7O95471 211 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 MT-CO3P00414 261 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 STC1P52823 247 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 CLDN6P56747 220 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 CDK3Q00526 305 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 ADCY2Q08462 1091 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 SLC14A2Q15849 920 aa22.94■■□□□ 1.26
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PTPN4-208ENST00000460289 CCHCR1Q8TD31 782 aa22.94■■□□□ 1.26
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PTPN4-208ENST00000460289 CYP4F12Q9HCS2 524 aa22.94■■□□□ 1.26
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PTPN4-208ENST00000460289 IGF2RP11717 2491 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 PRSS38A1L453 326 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 PTPN3P26045 913 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 CETN2P41208 172 aa22.93■■□□□ 1.26
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PTPN4-208ENST00000460289 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa22.92■■□□□ 1.26
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