RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460170.2

PTPRU-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-205ENST00000460170 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF605Q86T29 641 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 HEXDCQ8WVB3 486 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 TWIST2Q8WVJ9 160 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 LPGAT1Q92604 370 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ASAH2Q9NR71 780 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 RAI2Q9Y5P3 530 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 TEX264Q9Y6I9 313 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 QSOX1O00391 747 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 MAP3K13O43283 966 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CST1P01037 141 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 MTX3Q5HYI7 312 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 RALGPS1Q5JS13 557 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PROSER1Q86XN7 944 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 TBC1D21Q8IYX1 336 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 OR52E6Q96RD3 313 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 GPR21Q99679 349 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 C1RP00736 705 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CCDC159P0C7I6 412 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CRATP43155 626 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 RPS7P62081 194 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SLC5A9Q2M3M2 681 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CLEC6AQ6EIG7 209 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PROX1Q92786 737 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 HMCESQ96FZ2 354 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 MYO19Q96H55 970 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 FIZ1Q96SL8 496 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 KLHL25Q9H0H3 589 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 KLHL3Q9UH77 587 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 AK5Q9Y6K8 562 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PEX6Q13608 980 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 DGCR6Q14129 220 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 OR6K2Q8NGY2 324 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SLC39A8Q9C0K1 460 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SIX4Q9UIU6 781 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 FAM159BA6NKW6 160 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SLC7A4O43246 635 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SGTAO43765 313 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 FTH1P02794 183 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 GAD2Q05329 585 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SGCGQ13326 291 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 DOK6Q6PKX4 331 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 FAM47BQ8NA70 645 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 UBE2E3Q969T4 207 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CORO1BQ9BR76 489 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ANKDD1BA6NHY2 528 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PPEF2O14830 753 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 NPHS1O60500 1241 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 GSNP06396 782 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 GNA12Q03113 381 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PLCL1Q15111 1095 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ACSBG2Q5FVE4 666 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 C6orf89Q6UWU4 347 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 RELL1Q8IUW5 271 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 UBR7Q8N806 425 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 BBS4Q96RK4 519 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PIGVQ9NUD9 493 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 TIMM22Q9Y584 194 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 TRIM24O15164 1050 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 LYNP07948 512 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF460Q14592 562 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 KCNA10Q16322 511 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 OR2T34Q8NGX1 318 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 OR2T3Q8NH03 318 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 QRFPRQ96P65 431 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CIB1Q99828 191 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 MED26O95402 600 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 IDH2P48735 452 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 LCP2Q13094 533 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 C1orf220Q5T0J3 134 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms