RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447419.6

PTX4-203, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,516 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-203ENST00000447419 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 MOSPD1Q9UJG1 213 aa20.49■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa20.49■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 TMEM202A6NGA9 273 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 PIAS2O75928 621 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 NDST3O95803 873 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 AGTP01019 485 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 MYF5P13349 255 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 MTM1Q13496 603 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 NFATC4Q14934 902 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 ALS2CLQ60I27 953 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 DBX2Q6ZNG2 339 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 TRIM74Q86UV6 250 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 HEATR4Q86WZ0 1026 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 FAM174AQ8TBP5 190 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 LMX1AQ8TE12 382 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 AP2M1Q96CW1 435 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 SPATA13Q96N96 652 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 WDR26Q9H7D7 661 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 LRRK1Q38SD2 2015 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 ZSCAN12O43309 604 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 LIASO43766 372 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 USP12O75317 370 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 FGGP02679 453 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 CSF2P04141 144 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 YPEL5P62699 121 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 PTK2BQ14289 1009 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 ALG11Q2TAA5 492 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 DOK6Q6PKX4 331 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 MACC1Q6ZN28 852 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 PHACTR4Q8IZ21 702 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 PDXPQ96GD0 296 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 FSD1LQ9BXM9 530 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 BPIFA1Q9NP55 256 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 ZNF711Q9Y462 761 aa20.48■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 PSMD11O00231 422 aa20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 TRIM38O00635 465 aa20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 INPP4BO15327 924 aa20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 METTL18O95568 372 aa20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 ETS1P14921 441 aa20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 NME1P15531 152 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 ZNF30P17039 623 aa20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 GPR1P46091 355 aa20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 DNAJC3Q13217 504 aa20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 PRRT3Q5FWE3 981 aa20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 MS4A14Q96JA4 679 aa20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 GPR63Q9BZJ6 419 aa20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 FGF22Q9HCT0 170 aa20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 KLQ9UEF7 1012 aa20.47■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 YKT6O15498 198 aa20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 GCATO75600 419 aa20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 SOD1P00441 154 aa20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 IFNB1P01574 187 aa20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 HTR1BP28222 390 aa20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 POLD2P49005 469 aa20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 PPARDQ03181 441 aa20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 DEFB133Q30KQ1 61 aa20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 OR1E3Q8WZA6 343 aa20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 LYSMD1Q96S90 227 aa20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 FTSJ1Q9UET6 329 aa20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 SPTBN2O15020 2390 aa20.46■□□□□ 0.87
PTX4-203ENST00000447419 SPINK2P20155 84 aa20.45■□□□□ 0.86
PTX4-203ENST00000447419 SPINT3P49223 89 aa20.45■□□□□ 0.86
PTX4-203ENST00000447419 GEMP55040 296 aa20.45■□□□□ 0.86
PTX4-203ENST00000447419 SRP54P61011 504 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PTX4-203ENST00000447419 FOXC1Q12948 553 aa20.45■□□□□ 0.86
PTX4-203ENST00000447419 MPP3Q13368 585 aa20.45■□□□□ 0.86
PTX4-203ENST00000447419 SLC1A5Q15758 541 aa20.45■□□□□ 0.86
PTX4-203ENST00000447419 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PTX4-203ENST00000447419 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.45■□□□□ 0.86
PTX4-203ENST00000447419 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PTX4-203ENST00000447419 WDR92Q96MX6 357 aa20.45■□□□□ 0.86
PTX4-203ENST00000447419 WDR24Q96S15 920 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms