RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 HLA-DPA1P20036 260 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 VHLP40337 213 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCNG1P51959 295 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 USP46P62068 366 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRAMEP78395 509 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 IL10RBQ08334 325 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ITKQ08881 620 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 EFEMP1Q12805 493 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ITGA9Q13797 1035 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 POU6F1Q14863 301 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAPRE2Q15555 327 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM83EQ2M2I3 478 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CMPK2Q5EBM0 449 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 RABGAP1LQ5R372 815 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 AFMIDQ63HM1 303 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF470Q6ECI4 717 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CEP68Q76N32 757 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLEC14AQ86T13 490 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC22A9Q8IVM8 553 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNASE1L2Q92874 299 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MFSD3Q96ES6 412 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF599Q96NL3 588 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SERPINI1Q99574 410 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 NACA2Q9H009 215 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDH19Q9H159 772 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 YY1AP1Q9H869 796 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 HACD3Q9P035 362 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 EMCNQ9ULC0 261 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 NEU3Q9UQ49 428 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDYLQ9Y232 598 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PSAT1Q9Y617 370 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 AKAP13Q12802 2813 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 OBSL1O75147 1896 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM92AA1XBS5 289 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CAPN14A8MX76 684 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 B2RBV5 119 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 GSC2O15499 205 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC7A4O43246 635 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 NPHS1O60500 1241 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PEX11AO75192 247 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PMPCBO75439 489 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TM7SF2O76062 418 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 EPN2O95208 641 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBP1P09455 135 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 T-ENOLP0DO92 83 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHRNB1P11230 501 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 NMBRP28336 390 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC26A3P40879 764 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC1A2P43004 574 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC11A2P49281 568 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAP1GDS1P52306 607 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 KDSRQ06136 332 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TNK2Q07912 1038 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPR17Q13304 367 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TAF11Q15544 211 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLA2G2CQ5R387 149 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM45BPQ6NSW5 357 aa6.32□□□□□ -1.4
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