RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427193.1

C9orf3-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-205ENST00000427193 TFDP1Q14186 410 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 LPIN1Q14693 890 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 MAPK6Q16659 721 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 XKR4Q5GH76 650 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 TCEAL5Q5H9L2 206 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 FAM228AQ86W67 206 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 MPP5Q8N3R9 675 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 METTL13Q8N6R0 699 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 RAD9AQ99638 391 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 CBWD1Q9BRT8 395 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 ADGRE3Q9BY15 652 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 PDZD7Q9H5P4 517 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 ERVK-5Q9HDB9 667 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF580Q9UK33 172 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 TRPV2Q9Y5S1 764 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 EVPLQ92817 2033 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 PTPRSQ13332 1948 aa5.8□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 TANC1Q9C0D5 1861 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 FAM90A10PA6NDY2 464 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 LOC730098B7Z3J9 87 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 ZZEF1O43149 2961 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 NBNO60934 754 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 NR3C1P04150 777 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 MCF2P10911 925 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 AXLP30530 894 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 STX17P56962 302 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 LINC00205P59089 165 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 WDR5P61964 334 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 DEFB103AP81534 67 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 STIM1Q13586 685 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 ZBTB6Q15916 424 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 PTCHD3Q3KNS1 767 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 TCP11X2Q5H9J9 407 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 TMEM65Q6PI78 240 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 ALKAL1Q6UXT8 129 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 DEF8Q6ZN54 512 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 NELFCDQ8IXH7 590 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 DEPTORQ8TB45 409 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 SLC35C1Q96A29 364 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 CCDC51Q96ER9 411 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 NLRP4Q96MN2 994 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 SIGLEC11Q96RL6 698 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 CDT1Q9H211 546 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 ZHX3Q9H4I2 956 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 SMURF2Q9HAU4 748 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 CHST12Q9NRB3 414 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 EXOC7Q9UPT5 735 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 USP22Q9UPT9 525 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 CDY1Q9Y6F8 540 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 CEP295Q9C0D2 2601 aa5.79□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 A0A0U1RQF3 1178 aa5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 TTC26A0AVF1 554 aa5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 E2F8A0AVK6 867 aa5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 SMTNL1A8MU46 457 aa5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 CLIC2O15247 247 aa5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 EXTL3O43909 919 aa5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 MGEA5O60502 916 aa5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 OAZ2O95190 189 aa5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 PARNO95453 639 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 GNA14O95837 355 aa5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 KITP10721 976 aa5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 NR2F2P24468 414 aa5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 THPOP40225 353 aa5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 COPB1P53618 953 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 KRT31Q15323 416 aa5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 NAB2Q15742 525 aa5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 INSCQ1MX18 579 aa5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 TCTN1Q2MV58 587 aa5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 ATF7IP2Q5U623 682 aa5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-205ENST00000427193 ANO7Q6IWH7 933 aa5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms