RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRMOQ9BU70 441 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MEAF6Q9HAF1 191 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POMPQ9Y244 141 aa18.7■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C2orf81A6NN90 581 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNAP91O60641 907 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMCC1O94876 653 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACADSP16219 412 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDC25CP30307 473 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1QTNF8P60827 252 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AAGABQ6PD74 315 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF783Q6ZMS7 281 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIRREL3Q8IZU9 778 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PELI3Q8N2H9 469 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LPGAT1Q92604 370 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOP1MTQ969P6 601 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM136AQ96C01 138 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MIEF2Q96C03 454 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC22A12Q96S37 553 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP2S1Q96SQ9 504 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBED2Q9BTP6 218 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPM1HQ9ULR3 514 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUPT7LO94864 414 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABL2P42684 1182 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HERVK_113P63132 956 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCNIQ14094 377 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM68Q6AZZ1 485 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM117BQ6P1L5 589 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EFCAB3Q8N7B9 438 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KYQ8NBH2 561 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERVK-6Q9BXR3 956 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBX21Q9UL17 535 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OBSL1O75147 1896 aa18.69■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LTBP2Q14767 1821 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD66B4E2M5 251 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H0Y626 953 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H3BMM5 538 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBL1XO60907 577 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMIM24O75264 130 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 URODP06132 367 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LPOP22079 712 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAF2Q12933 501 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR4D1Q15615 310 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C16orf89Q6UX73 402 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CARNMT1Q8N4J0 409 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPFIBP2Q8ND30 876 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AUTS2Q8WXX7 1259 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 JADE3Q92613 823 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EXT2Q93063 718 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RCN3Q96D15 328 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTC1Q99614 292 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGRE3Q9BY15 652 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRPC7Q9HCX4 862 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDE1Q9NXR1 346 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SAGE1Q9NXZ1 904 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MED16Q9Y2X0 877 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INSL5Q9Y5Q6 135 aa18.68■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LATS1O95835 1130 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INHBCP55103 352 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BLMHQ13867 455 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UNC50Q53HI1 259 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHSY3Q70JA7 882 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCEAL8Q8IYN2 117 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DSELQ8IZU8 1212 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RHEBL1Q8TAI7 183 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCF12Q99081 682 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 S100A14Q9HCY8 104 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LHX3Q9UBR4 397 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RHOBTB1O94844 696 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FMO4P31512 558 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EPHB3P54753 998 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NCEH1Q6PIU2 408 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATOH8Q96SQ7 321 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FEM1AQ9BSK4 669 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAS2R13Q9NYV9 303 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VPS28Q9UK41 221 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM50BQ9Y247 325 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAF6Q9Y4K3 522 aa18.67■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBXN8O00124 270 aa18.66■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP3K7O43318 606 aa18.66■□□□□ 0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GREM1O60565 184 aa18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms