RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423113.5

ITGB1-205, Transcript of integrin subunit beta 1, human

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene ITGB1, Length 3,729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITGB1-205	ENST00000423113	MMRN1	Q13201	1228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	PRPSAP1	Q14558	356 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	SNX31	Q8N9S9	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	RNF149	Q8NC42	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	SUSD3	Q96L08	255 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	MRO	Q9BYG7	248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	MTRR	Q9UBK8	725 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	PSME2	Q9UL46	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	MAGEB16	A2A368	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ISPD	A4D126	451 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ARL5C	A6NH57	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113		F8W810	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	B4GALT5	O43286	388 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	AKAP3	O75969	853 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	FAM13A	O94988	1023 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	TGDS	O95455	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ALB	P02768	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	UGT2B4	P06133	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	RALA	P11233	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	PSKH1	P11801	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	IL10	P22301	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	RRM2	P31350	389 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	OR2B6	P58173	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	CASC4	Q6P4E1	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	PHF21A	Q96BD5	680 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	TM9SF2	Q99805	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ZBP1	Q9H171	429 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	CHRD	Q9H2X0	955 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	NTN4	Q9HB63	628 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	RAB20	Q9NX57	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	CFL2	Q9Y281	166 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	LRP4	O75096	1905 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113		K7ENM7	598 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113		K7ERI5	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	B4GALT3	O60512	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	CLIC3	O95833	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	NPPA	P01160	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	FGFR1	P11362	822 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	CD58	P19256	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ASPA	P45381	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ARHGDIA	P52565	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	RHAG	Q02094	409 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	PMS2P3	Q13401	168 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	APOF	Q13790	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	OXA1L	Q15070	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	CCDC14	Q49A88	953 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ZNF544	Q6NX49	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms