RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 PEX14O75381 377 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PIGNO95427 931 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ENO1P06733 434 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SYN1P17600 705 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CTPS1P17812 591 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CES1P23141 567 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CDC25CP30307 473 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 BMPR1AP36894 532 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CCR2P41597 374 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CDKN2DP55273 166 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC7A9P82251 487 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SEMA3AQ14563 771 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM83EQ2M2I3 478 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM240Q5SV17 173 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR158Q5T848 1215 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 AGAP9Q5VTM2 703 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ARMC3Q5W041 872 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 NCEH1Q6PIU2 408 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF783Q6ZMS7 281 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 HTR3DQ70Z44 454 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SPRED2Q7Z698 418 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PIM3Q86V86 326 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CMTM8Q8IZV2 173 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 OR6Y1Q8NGX8 325 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SH3RF2Q8TEC5 729 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD49Q8WVL7 239 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 HLA-CQ95604 372 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TCEAL4Q96EI5 215 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ALG14Q96F25 216 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPAN17Q96FV3 270 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP1R36Q96LQ0 422 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 UCN2Q96RP3 112 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ADGRE3Q9BY15 652 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM96AQ9H5X1 160 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TLE6Q9H808 572 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CYP4F12Q9HCS2 524 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MAN1C1Q9NR34 630 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LHX3Q9UBR4 397 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 STK39Q9UEW8 545 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CCL26Q9Y258 94 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 OR51B4Q9Y5P0 310 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 A8MUI8 341 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TARM1B6A8C7 271 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 STX7O15400 261 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MGRN1O60291 552 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ADH1CP00326 375 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LPOP22079 712 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MPSTP25325 297 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJB1P25685 340 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PTPN4P29074 926 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 FMO4P31512 558 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 GKP32189 559 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CD70P32970 193 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 IDH3AP50213 366 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PLK1P53350 603 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ACVR1Q04771 509 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 KDSRQ06136 332 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LMAN2Q12907 356 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MPPE1Q53F39 396 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF787Q6DD87 383 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RETSATQ6NUM9 610 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 KLC3Q6P597 504 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF549Q6P9A3 640 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MAVSQ7Z434 540 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LCA5Q86VQ0 697 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LONP2Q86WA8 852 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TREML1Q86YW5 311 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CAMK1DQ8IU85 385 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LMNTD2Q8IXW0 634 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RDH11Q8TC12 318 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SPPL3Q8TCT6 385 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 INPP5DQ92835 1189 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PEX13Q92968 403 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PHF21BQ96EK2 531 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 C17orf80Q9BSJ5 609 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TUBB6Q9BUF5 446 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CDH19Q9H159 772 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LRMDAQ9H2I8 198 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TNKS2Q9H2K2 1166 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms