RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 SPOCK2Q92563 424 aa17.76■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 PEX13Q92968 403 aa17.76■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 PPP1R16AQ96I34 528 aa17.76■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 GABRG3Q99928 467 aa17.76■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 CATSPERZQ9NTU4 200 aa17.76■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 OGFRQ9NZT2 677 aa17.76■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 SORCS3Q9UPU3 1222 aa17.76■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 HMX2A2RU54 273 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 GOLGA8RI6L899 631 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 SPINT1O43278 529 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 BPIP17213 487 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 GABRB3P28472 473 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 ATP5DP30049 168 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 SATB1Q01826 763 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 CNTN1Q12860 1018 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 RALGDSQ12967 914 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 RASA2Q15283 850 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 E2F5Q15329 346 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 CST6Q15828 149 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 TRABD2AQ86V40 505 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 EXOC3L1Q86VI1 746 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 CNTN4Q8IWV2 1026 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 C4orf33Q8N1A6 199 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 MSANTD3Q96H12 275 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 RBBP8Q99708 897 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 SELENOSQ9BQE4 189 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 ARHGEF3Q9NR81 526 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 CD84Q9UIB8 345 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 FBXL21Q9UKT6 434 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 KRT37O76014 449 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 KRT38O76015 456 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 ADRB3P13945 408 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 MMP12P39900 470 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 HADHAP40939 763 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 SERPINB9P50453 376 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 NEK3P51956 506 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 PTSQ03393 145 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 PEX6Q13608 980 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 CCINQ13939 588 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 ERAP2Q6P179 960 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 Q6ZS52 159 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 DPPA4Q7L190 304 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 TAOK1Q7L7X3 1001 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 ACVR1CQ8NER5 493 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 CALML6Q8TD86 181 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 SERAC1Q96JX3 654 aa17.75■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 A0A1W2PQF6 199 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 AHSGP02765 367 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 ITGA2BP08514 1039 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 FOXN2P32314 431 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 P2RY2P41231 377 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 STC1P52823 247 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 COPAP53621 1224 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 XIAPP98170 497 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 GRTP1Q5TC63 336 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 FAM46CQ5VWP2 391 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 CNSTQ6PJW8 725 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 CILP2Q8IUL8 1156 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 AADATQ8N5Z0 425 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 GPR26Q8NDV2 337 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 OR2T3Q8NH03 318 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 HCAR2Q8TDS4 363 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 VPS39Q96JC1 886 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 SCN8AQ9UQD0 1980 aa17.73■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 ATG2BQ96BY7 2078 aa17.73■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 SPAG7O75391 227 aa17.73■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 HAUS5O94927 633 aa17.73■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 PRAMEF1O95521 474 aa17.73■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 MT-ND3P03897 115 aa17.73■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 NR1D1P20393 614 aa17.73■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 SAT1P21673 171 aa17.73■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 PSMA3P25788 255 aa17.73■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 SPRP35270 261 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 ATP1A2P50993 1020 aa17.73■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 LIMK2P53671 638 aa17.73■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 RPS14P62263 151 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 LGSNQ5TDP6 509 aa17.73■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 ZNF852Q6ZMS4 543 aa17.73■□□□□ 0.43
LTV1-201ENST00000367576 TAS2R42Q7RTR8 314 aa17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms