RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 UBDO15205 165 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 CRTAMO95727 393 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 GNRH1P01148 92 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC2A3P11169 496 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 ARSDP51689 593 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 CDKN2DP55273 166 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM156AQ8NDB6 213 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 PSMG2Q969U7 264 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 ASB9Q96DX5 294 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 NACA2Q9H009 215 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 TRPC7Q9HCX4 862 aa18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 CHD9Q3L8U1 2897 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 FBP2O00757 339 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 TFAP2AP05549 437 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 IMPDH1P20839 514 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 ACVRL1P37023 503 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC26A3P40879 764 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 RPL5P46777 297 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNC1P48547 511 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 TNK2Q07912 1038 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR17Q13304 367 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP1R3AQ16821 1122 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 HDAC10Q969S8 669 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 C8orf48Q96LL4 319 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 ADA2Q9NZK5 511 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 PITPNM1O00562 1244 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 PENKP01210 267 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 MAPRE2Q15555 327 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 SIRPB2Q5JXA9 342 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 ISCA2Q86U28 154 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXO44Q9H4M3 255 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 TRAF6Q9Y4K3 522 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1-201ENST00000357436 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 OR6B1O95007 311 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 ETS2P15036 469 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 CSF2RAP15509 400 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 CYHR1Q6ZMK1 362 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 OR6P1Q8NGX9 317 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 ARRDC2Q8TBH0 407 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 WBP2Q969T9 261 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 L3HYPDHQ96EM0 354 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 TRMOQ9BU70 441 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM39AQ9NV64 488 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 AP4B1Q9Y6B7 739 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 E7ENX8 843 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 PGM3O95394 542 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 AGKQ53H12 422 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 SPATA24Q86W54 205 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 OR52K2Q8NGK3 314 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 CYP2S1Q96SQ9 504 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 SP110Q9HB58 689 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A0D9SEW6 157 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 LDB2O43679 373 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR158Q5T848 1215 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 REP15Q6BDI9 236 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 AHI1Q8N157 1196 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 PGBD5Q8N414 524 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 SH3RF2Q8TEC5 729 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 ALG9Q9H6U8 611 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 PLK2Q9NYY3 685 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC167Q9P0B6 97 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHGB4Q9UN71 923 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM24O15164 1050 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF678Q5SXM1 525 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 NADSYN1Q6IA69 706 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 PAOXQ6QHF9 649 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 OTOP2Q7RTS6 562 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 BEGAINQ9BUH8 593 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF696Q9H7X3 374 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 LZTS1Q9Y250 596 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 KCTD3Q9Y597 815 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1B0GVG6 124 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHL33A6NCF5 533 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 OR51F1A6NGY5 319 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1-201ENST00000357436 TSPAN3O60637 253 aa18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms