RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 ALDH4A1P30038 563 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 S100A7P31151 101 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ARFIP1P53367 373 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 RAB10P61026 200 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 RPS6P62753 249 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 KCNA1Q09470 495 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 MAP2K5Q13163 448 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 FAM126BQ8IXS8 530 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SLC44A1Q8WWI5 657 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 AP2M1Q96CW1 435 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 FTHL17Q9BXU8 183 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRA2Q9H9E1 313 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM39AQ9NV64 488 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 EXD2Q9NVH0 621 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CYP26A1O43174 497 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 FYNP06241 537 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 GSTT2P0CG29 244 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 KITP10721 976 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ACO1P21399 889 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PPM1AP35813 382 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PBX1P40424 430 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 APLP1P51693 650 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 RPP38P78345 283 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 VAC14Q08AM6 782 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 KCNC3Q14003 757 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 NFE2L1Q14494 772 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF284Q2VY69 593 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 FAM228AQ86W67 206 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 KCNV2Q8TDN2 545 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 RMI1Q9H9A7 625 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ENTPD4Q9Y227 616 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 USP27XA6NNY8 438 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 E7ENX8 843 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 RPS17P08708 135 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PTPRAP18433 802 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 S100A3P33764 101 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CTBP2P56545 445 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 EFR3AQ14156 821 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 FAM110CQ1W6H9 321 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CDC6Q99741 560 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM117Q9H0C3 514 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 FOLH1BQ9HBA9 442 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CATSPERZQ9NTU4 200 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SIK3Q9Y2K2 1263 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 USP20Q9Y2K6 914 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 FADS2P1A8MWK0 482 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 MYO1GB0I1T2 1018 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF879B4DU55 563 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 H3BNH8 94 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 GSC2O15499 205 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 AVILO75366 819 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 IL3P08700 152 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 POU1F1P28069 291 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 THPOP40225 353 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 DNAJB13P59910 316 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TRPV3Q8NET8 790 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TEX47Q8TBZ9 253 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SLC7A13Q8TCU3 470 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM174Q8WUU8 243 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CXorf40BQ96DE9 158 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TBL1YQ9BQ87 522 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 GPR63Q9BZJ6 419 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 INVSQ9Y283 1065 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TRPV2Q9Y5S1 764 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ADAMTSL3P82987 1691 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SH3D21A4FU49 640 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PITPNM1O00562 1244 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PRRG1O14668 218 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 UROSP10746 265 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CCNFP41002 786 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 IL5RAQ01344 420 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 POU4F2Q12837 409 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PARP15Q460N3 678 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 RTL6Q6ICC9 239 aa4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms