RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 ALG2Q9H553 416 aa8.23□□□□□ -1.09
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PKHD1-201ENST00000340994 PON3Q15166 354 aa8.23□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.23□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
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PKHD1-201ENST00000340994 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
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PKHD1-201ENST00000340994 PEX2P28328 305 aa8.22□□□□□ -1.09
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PKHD1-201ENST00000340994 RAB27AP51159 221 aa8.22□□□□□ -1.09
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PKHD1-201ENST00000340994 M0R233 179 aa8.22□□□□□ -1.09
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PKHD1-201ENST00000340994 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 ECHS1P30084 290 aa8.22□□□□□ -1.09
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PKHD1-201ENST00000340994 CEP76Q8TAP6 659 aa8.22□□□□□ -1.09
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PKHD1-201ENST00000340994 HTR2AP28223 471 aa8.22□□□□□ -1.09
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PKHD1-201ENST00000340994 RHOJQ9H4E5 214 aa8.22□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 C14orf105Q9NVL8 296 aa8.22□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PKHD1-201ENST00000340994 RGL2O15211 777 aa8.22□□□□□ -1.09
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PKHD1-201ENST00000340994 C7P10643 843 aa8.22□□□□□ -1.09
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