RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330295.9

CTHRC1-201, Transcript of collagen triple helix repeat containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTHRC1, Length 1,271 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1-201ENST00000330295 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.76□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.76□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14.76□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 NUDT9Q9BW91 350 aa14.76□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 ANO10Q9NW15 660 aa14.76□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 MPP6Q9NZW5 540 aa14.76□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 C21orf140B9A014 251 aa14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 KIAA0754O94854 1291 aa14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 CD1EP15812 388 aa14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 FOXM1Q08050 763 aa14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 TMEM270Q6UE05 265 aa14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 ZNF783Q6ZMS7 281 aa14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 GPT2Q8TD30 523 aa14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 CT55Q8WUE5 264 aa14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 LGR4Q9BXB1 951 aa14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 PADI1Q9ULC6 663 aa14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 DOCK4Q8N1I0 1966 aa14.74□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 DRGXA6NNA5 263 aa14.74□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 NDUFA10O95299 355 aa14.74□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 CAPN3P20807 821 aa14.74□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 SUOXP51687 545 aa14.74□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 NDST2P52849 883 aa14.74□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 GCNT1Q02742 428 aa14.74□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 TAF5Q15542 800 aa14.74□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 GBP6Q6ZN66 633 aa14.74□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.74□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 HDAC11Q96DB2 347 aa14.74□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 HMCESQ96FZ2 354 aa14.74□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 MED15Q96RN5 788 aa14.74□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 SLC38A3Q99624 504 aa14.74□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 KLHL3Q9UH77 587 aa14.74□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.74□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.74□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 CALCAP01258 141 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 PTMSP20962 102 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 PTGIRP43119 386 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 GPD2P43304 727 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 FASLGP48023 281 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 LIG3P49916 1009 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 KRTAP10-9P60411 292 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 RPS18P62269 152 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 NME3Q13232 169 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 PEX6Q13608 980 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 IL10RAQ13651 578 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 MAN2A1Q16706 1144 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 MIIPQ5JXC2 388 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 RASGRP3Q8IV61 690 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 DEFB106AQ8N104 65 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 NCSTNQ92542 709 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 CHST11Q9NPF2 352 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 LHX9Q9NQ69 397 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 NTNG1Q9Y2I2 539 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 SNX10Q9Y5X0 201 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 ST14Q9Y5Y6 855 aa14.73□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa14.72□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.72□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 E5RJQ4 531 aa14.72□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 SSTR2P30874 369 aa14.72□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 TRIM23P36406 574 aa14.72□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 GNA12Q03113 381 aa14.72□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 STX1AQ16623 288 aa14.72□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.72□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.72□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 LRRC31Q6UY01 552 aa14.72□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 SYVN1Q86TM6 617 aa14.72□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 NXPE1Q8N323 547 aa14.72□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.72□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 SLC2A13Q96QE2 648 aa14.72□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 RUFY1Q96T51 708 aa14.72□□□□□ -0.05
CTHRC1-201ENST00000330295 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms