RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324727.8

SCN4B-201, Transcript of sodium voltage-gated channel beta subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCN4B, Length 4,484 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4B-201ENST00000324727 SNX8Q9Y5X2 465 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 APC2O95996 2303 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 NDUFB5O43674 189 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 TIPRLO75663 272 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 MPOP05164 745 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 MSH3P20585 1137 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 TALDO1P37837 337 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 ACADVLP49748 655 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 SOWAHAQ2M3V2 549 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 PDPRQ8NCN5 879 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 OR7D4Q8NG98 312 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 ITFG1Q8TB96 612 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 PLEKHO2Q8TD55 490 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 TRHDEQ9UKU6 1024 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 NID2Q14112 1375 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 OR6C75A6NL08 312 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 PSMD11O00231 422 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 CCRL2O00421 344 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 C1RP00736 705 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 ABATP80404 500 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 PURAQ00577 322 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 GRB14Q14449 540 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 ZNF792Q3KQV3 632 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 SLC25A52Q3SY17 297 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 GRPEL2Q8TAA5 225 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 TMEM159Q96B96 161 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 J3QRK9 145 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 BTN3A1O00481 513 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 NRP1O14786 923 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 STAU1O95793 577 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 RBP1P09455 135 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 SERPINA4P29622 427 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 PTGS2P35354 604 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 ENTPD1P49961 510 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 PWP1Q13610 501 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 C1DQ13901 141 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 TYSND1Q2T9J0 566 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 RALGPS1Q5JS13 557 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 SLC39A4Q6P5W5 647 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 NPAS4Q8IUM7 802 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 CCDC185Q8N715 623 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 ZNF614Q8N883 585 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 FBXL8Q96CD0 374 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 UGT2B28Q9BY64 529 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 PNPOQ9NVS9 261 aa11.66□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 OR6B1O95007 311 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 TUBA3CQ13748 450 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 POTEHQ6S545 545 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 CSPG4P5Q96PW8 444 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 TCF25Q9BQ70 676 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 TRIM8Q9BZR9 551 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 MFSD1Q9H3U5 465 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 GRHL1Q9NZI5 618 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 KAT6AQ92794 2004 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 ASXL3Q9C0F0 2248 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 ARVCFO00192 962 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 PER2O15055 1255 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 LRIG2O94898 1065 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 PRLP01236 227 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 PCNAP12004 261 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 KRT20P35900 424 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 HNF4AP41235 474 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 CERCAMQ5T4B2 595 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 ERAP2Q6P179 960 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 PEX5LQ8IYB4 626 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 CYP4X1Q8N118 509 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 PCYT2Q99447 389 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 C3orf18Q9UK00 162 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 SPEF2Q9C093 1822 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 A0A1W2PQ72 361 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 TPP1O14773 563 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 GUCY1B2O75343 617 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 STBD1O95210 358 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 BPGMP07738 259 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 WNT3AP56704 352 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 PHC1P78364 1004 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 QPRTQ15274 297 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms