RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 GABRDO14764 452 aa16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ZMPSTE24O75844 475 aa16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 RCN3Q96D15 328 aa16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ARL8BQ9NVJ2 186 aa16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 SGTAO43765 313 aa16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 COX7A2P14406 83 aa16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 PLD3Q8IV08 490 aa16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 EID3Q8N140 333 aa16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 TMEM79Q9BSE2 394 aa16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 RTKNQ9BST9 563 aa16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ATAD3AQ9NVI7 634 aa16.49■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 EDIL3O43854 480 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 UGT2B4P06133 528 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 PTPN2P17706 415 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 MAGEA11P43364 429 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 GPR17Q13304 367 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 TMEM63BQ5T3F8 832 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ULK2Q8IYT8 1036 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 KRT78Q8N1N4 520 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 PEBP4Q96S96 227 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 DEC1Q9P2X7 70 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 A0A1W2PQY0 241 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ANKDD1BA6NHY2 528 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 A8MUI8 341 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 FFAR3O14843 346 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 GPR42O15529 346 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ATP6AP2O75787 350 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 EPN2O95208 641 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 MAPKAPK3Q16644 382 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 CNKSR3Q6P9H4 555 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF621Q6ZSS3 439 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 RELL1Q8IUW5 271 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 PQLC3Q8N755 202 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 GLIS1Q8NBF1 620 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 HAPLN2Q9GZV7 340 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 TLE6Q9H808 572 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 BRD9Q9H8M2 597 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ANAPC2Q9UJX6 822 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 GABRQQ9UN88 632 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 C8AP07357 584 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 POM121L1PQ3SYA9 428 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 CNSTQ6PJW8 725 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 RD3Q7Z3Z2 195 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 PIGWQ7Z7B1 504 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 TRIM69Q86WT6 500 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 WDTC1Q8N5D0 677 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 FITM2Q8N6M3 262 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ATG16L2Q8NAA4 619 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ADPRHL2Q9NX46 363 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 STRCQ7RTU9 1775 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 NFATC1O95644 943 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 GALNT2Q10471 571 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 KLF10Q13118 480 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 FBXL22Q6P050 247 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 GPR141Q7Z602 305 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ADCK1Q86TW2 530 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 TCAIMQ8N3R3 496 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 KREMEN2Q8NCW0 462 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 DCAKDQ8WVC6 231 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 TRIB2Q92519 343 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 GPR21Q99679 349 aa16.48■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 GUCY1B2O75343 617 aa16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 GOT2P00505 430 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 MAPK9P45984 424 aa16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 FBXW4P57775 412 aa16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 BNIP2Q12982 314 aa16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ASZ1Q8WWH4 475 aa16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 CCDC3Q9BQI4 270 aa16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 YIPF1Q9Y548 306 aa16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 TEX264Q9Y6I9 313 aa16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 KCNE2Q9Y6J6 123 aa16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 MYH11P35749 1972 aa16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 BBIP1A8MTZ0 92 aa16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 POP4O95707 220 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 TBX18O95935 607 aa16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 NRLP54845 237 aa16.47■□□□□ 0.23
ITGA3-202ENST00000320031 RPL38P63173 70 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms