RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 UGCGQ16739 394 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM139Q8IV31 216 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 C12orf56Q8IXR9 622 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SIN3BO75182 1162 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 B4GALT5O43286 388 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 OLR1P78380 273 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 CRTC3Q6UUV7 619 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC34A3Q8N130 599 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 PPCDCQ96CD2 204 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 LHX5Q9H2C1 402 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 GALNT8Q9NY28 637 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM151BQ6UXP7 276 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 KREMEN1Q96MU8 473 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 FZD1Q9UP38 647 aa24.15■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.14■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 DHX15O43143 795 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 OR5F1O95221 314 aa24.14■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 BNC1Q01954 994 aa24.14■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 FSTL1Q12841 308 aa24.14■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 ARSHQ5FYA8 562 aa24.14■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 GLYATQ6IB77 296 aa24.14■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SCAIQ8N9R8 606 aa24.14■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 HTRA1Q92743 480 aa24.14■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM210AQ96ND0 272 aa24.14■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.14■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 RBFAQ8N0V3 343 aa24.14■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 FITM2Q8N6M3 262 aa24.14■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa24.14■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 CASKO14936 926 aa24.14■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 TFECO14948 347 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 C2P06681 752 aa24.14■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 TAS2R41P59536 307 aa24.14■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC25A52Q3SY17 297 aa24.14■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 ACSL4O60488 711 aa24.14■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 HECTD2Q5U5R9 776 aa24.14■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa24.14■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 THAP5Q7Z6K1 395 aa24.14■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 OR10H1Q9Y4A9 318 aa24.14■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 OR10H2O60403 315 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 DGKBQ9Y6T7 804 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 IRGMA1A4Y4 181 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 TCF4P15884 667 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 CTSKP43235 329 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 LLGL2Q6P1M3 1020 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 MKL2Q9ULH7 1088 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 IPO13O94829 963 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 MYBPC1Q00872 1141 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 SIX5Q8N196 739 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 PGRMC2O15173 223 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 CES1P23141 567 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 TAPT1Q6NXT6 567 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 CLHC1Q8NHS4 586 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 NAT14Q8WUY8 206 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 CDCA5Q96FF9 252 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL32Q96NJ5 620 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 RHBDL3P58872 404 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 RTP1P59025 263 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 IL31RAQ8NI17 732 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 GLOD4Q9HC38 313 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 GPSM3Q9Y4H4 160 aa24.13■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM92AA1XBS5 289 aa24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 ADM5C9JUS6 153 aa24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 XYLT1Q86Y38 959 aa24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 ACSS2Q9NR19 701 aa24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNU1A8MYU2 1149 aa24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 BCKDKO14874 412 aa24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 COL6A2P12110 1019 aa24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 TCEA2Q15560 299 aa24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 REP15Q6BDI9 236 aa24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 ADGRD1Q6QNK2 874 aa24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 LYNP07948 512 aa24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 IGFBP5P24593 272 aa24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 PGAM4Q8N0Y7 254 aa24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 LPPQ93052 612 aa24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL5Q96PQ7 755 aa24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNE2Q9Y6J6 123 aa24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms