RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 IL23RQ5VWK5 629 aa20.18■□□□□ 0.82
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HPS6-201ENST00000299238 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS6-201ENST00000299238 IGFN1Q86VF2 1251 aa20.18■□□□□ 0.82
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HPS6-201ENST00000299238 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
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HPS6-201ENST00000299238 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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HPS6-201ENST00000299238 HK2P52789 917 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS6-201ENST00000299238 IFITM2Q01629 132 aa20.16■□□□□ 0.82
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