RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 OR2AP1Q8NGE2 309 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ITFG1Q8TB96 612 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 LPGAT1Q92604 370 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 RILPQ96NA2 401 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 GPR63Q9BZJ6 419 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEE1Q9HCI5 957 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 NEMP2A6NFY4 417 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 BNIP3LO60238 219 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 FMO4P31512 558 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 AGR3Q8TD06 166 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 VOPP1Q96AW1 172 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 SIKE1Q9BRV8 207 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 DRC3Q9H069 523 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 IL17CQ9P0M4 197 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ARMCX1Q9P291 453 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 MYOFQ9NZM1 2061 aa22.73■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 MAPK8P45983 427 aa22.72■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.72■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 PAF1Q8N7H5 531 aa22.72■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa22.72■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 HS3ST2Q9Y278 367 aa22.72■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 SOBPA7XYQ1 873 aa22.72■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF195O14628 629 aa22.72■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 GPR39O43194 453 aa22.72■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 NDUFS3O75489 264 aa22.72■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ATP5HO75947 161 aa22.72■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ACAP2Q15057 778 aa22.72■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa22.72■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa22.72■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 KLC3Q6P597 504 aa22.72■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ZSWIM9Q86XI8 627 aa22.72■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 MYLIPQ8WY64 445 aa22.72■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D14Q9P2M4 693 aa22.72■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 CFAP73A6NFT4 308 aa22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM24O15164 1050 aa22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 SOCS5O75159 536 aa22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 RASSF9O75901 435 aa22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 NQO1P15559 274 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 HMGCLP35914 325 aa22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 SUOXP51687 545 aa22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 PRKAA2P54646 552 aa22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 TUBB3Q13509 450 aa22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ACCSLQ4AC99 568 aa22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 C22orf39Q6P5X5 142 aa22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 NAT16Q8N8M0 369 aa22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 PIDD1Q9HB75 910 aa22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 SAR1AQ9NR31 198 aa22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ARL8BQ9NVJ2 186 aa22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 PKP3Q9Y446 797 aa22.71■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0J9YYE9 177 aa22.7■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 H7C0S8 307 aa22.7■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF197O14709 1029 aa22.7■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 OR1I1O60431 355 aa22.7■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 TRBC1P01850 177 aa22.7■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 TFEBP19484 476 aa22.7■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 KCNA5P22460 613 aa22.7■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 XIAPP98170 497 aa22.7■■□□□ 1.23
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VSTM4-201ENST00000298454 RCN2Q14257 317 aa22.7■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 SHHQ15465 462 aa22.7■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
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VSTM4-201ENST00000298454 TCF12Q99081 682 aa22.7■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 CDH19Q9H159 772 aa22.7■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 POMKQ9H5K3 350 aa22.7■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 ALG9Q9H6U8 611 aa22.7■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 FAM50BQ9Y247 325 aa22.7■■□□□ 1.23
VSTM4-201ENST00000298454 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
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VSTM4-201ENST00000298454 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 MPSTP25325 297 aa22.7■■□□□ 1.22
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VSTM4-201ENST00000298454 PBX2P40425 430 aa22.7■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 SLC26A3P40879 764 aa22.7■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 IDH3AP50213 366 aa22.7■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 RPL26P61254 145 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ERVK-21P61565 698 aa22.7■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ISCA2Q86U28 154 aa22.7■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CCNYL1Q8N7R7 359 aa22.7■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa22.7■■□□□ 1.22
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