RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 KIAA0408Q6ZU52 694 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 CAMK1DQ8IU85 385 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 MAB21L3Q8N8X9 362 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 TMEM169Q96HH4 297 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 MID2Q9UJV3 735 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 BTRCQ9Y297 605 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 MED16Q9Y2X0 877 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 RPP40O75818 363 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 RHOBTB1O94844 696 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 TMCC1O94876 653 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 FGF1P05230 155 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 CA5AP35218 305 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 CDH4P55283 916 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 PTPRNQ16849 979 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 PITRM1Q5JRX3 1037 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 CYHR1Q6ZMK1 362 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 TRPC4APQ8TEL6 797 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 FEM1CQ96JP0 617 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 GPR21Q99679 349 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 MGME1Q9BQP7 344 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 TTLL2Q9BWV7 592 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 MAGEH1Q9H213 219 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 DONSONQ9NYP3 566 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 TIMM22Q9Y584 194 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 SRP72O76094 671 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 HLA-DPA1P20036 260 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 MS4A2Q01362 244 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 TSNQ15631 228 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 APCDD1Q8J025 514 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 HMGCLL1Q8TB92 370 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 EID2BQ96D98 161 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 HBEGFQ99075 208 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 GSTO2Q9H4Y5 243 aa15.78■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 RGSL1A5PLK6 1076 aa15.77■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 GFAPP14136 432 aa15.77■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 CD1DP15813 335 aa15.77■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 MRNIPQ6NTE8 343 aa15.77■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 IZUMO2Q6UXV1 221 aa15.77■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 TAS2R42Q7RTR8 314 aa15.77■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 OTOP2Q7RTS6 562 aa15.77■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 ACTRT2Q8TDY3 377 aa15.77■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 IL1RL2Q9HB29 575 aa15.77■□□□□ 0.12
SLC20A1-201ENST00000272542 KDELR3O43731 214 aa15.77■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 LMNAP02545 664 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 ACAP2Q15057 778 aa15.77■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 UNC50Q53HI1 259 aa15.77■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 LRRC73Q5JTD7 316 aa15.77■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 HS6ST3Q8IZP7 471 aa15.77■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 FBXW8Q8N3Y1 598 aa15.77■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 RANBP9Q96S59 729 aa15.77■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 TNKS2Q9H2K2 1166 aa15.77■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 TRAF6Q9Y4K3 522 aa15.77■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 ASB1Q9Y576 335 aa15.77■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 CEP290O15078 2479 aa15.77■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 MYL4P12829 197 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 CCL5P13501 91 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 MTHFD2P13995 350 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 CSF2RAP15509 400 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 CCNG1P51959 295 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 STC1P52823 247 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 YBX1P67809 324 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 IKBKEQ14164 716 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 AGKQ53H12 422 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 PGM2L1Q6PCE3 622 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 CXorf56Q9H5V9 222 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 MID1IP1Q9NPA3 183 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 FNIP2Q9P278 1114 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 CPQQ9Y646 472 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 PLXNA3P51805 1871 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 ANKRD66B4E2M5 251 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 CLDN11O75508 207 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 MC4RP32245 332 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 RALGDSQ12967 914 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 CEACAM7Q14002 265 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 PAOXQ6QHF9 649 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 KYQ8NBH2 561 aa15.76■□□□□ 0.11
SLC20A1-201ENST00000272542 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms