RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258014.3

PKIB-201, Transcript of cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PKIB, Length 1,595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKIB-201ENST00000258014 CNPY2Q9Y2B0 182 aa3.21□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 CRYL1Q9Y2S2 319 aa3.21□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 PKP3Q9Y446 797 aa3.21□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa3.21□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 PIK3R4Q99570 1358 aa3.21□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 VWDEQ8N2E2 1590 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 FANCD2Q9BXW9 1451 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 NRXN1Q9ULB1 1477 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 KDRP35968 1356 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 POM121BA6NF01 834 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 FIBPO43427 364 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 RTN2O75298 545 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 SLC22A3O75751 556 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 GFPT2O94808 682 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 CAVIN2O95810 425 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 ATP1A3P13637 1013 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 ADD2P35612 726 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 PRPHP41219 470 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 MAGEA8P43361 318 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 C5orf22Q49AR2 442 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 BSPRYQ5W0U4 402 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 SLC30A9Q6PML9 568 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 NEK10Q6ZWH5 1172 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 GALNT5Q7Z7M9 940 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 IQCA1Q86XH1 822 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 OR8H2Q8N162 312 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 PGBD5Q8N414 524 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 CEP112Q8N8E3 955 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 CNNM3Q8NE01 707 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 HOMER3Q9NSC5 361 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 SMC3Q9UQE7 1217 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 IL16Q14005 1332 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 IFT140Q96RY7 1462 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 MYH1P12882 1939 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 ECM29Q5VYK3 1845 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 RRN3P2A6NIE6 340 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 ANKRD65E5RJM6 399 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 SYT5O00445 386 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 PES1O00541 588 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 RNMTO43148 476 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 ERLIN1O75477 346 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 CER1O95813 267 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 VDRP11473 427 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 PRKCHP24723 683 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 ABCD1P33897 745 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 GCKP35557 465 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 CD151P48509 253 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 OAZ1P54368 228 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 SLC8A3P57103 927 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 TNFAIP2Q03169 654 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 POSTNQ15063 836 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 SLC45A4Q5BKX6 768 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 WDR45BQ5MNZ6 344 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 LIN54Q6MZP7 749 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 KIAA1328Q86T90 577 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 TRIM74Q86UV6 250 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 TRIM73Q86UV7 250 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 TRABD2AQ86V40 505 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 CPOQ8IVL8 374 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 TMEM57Q8N5G2 664 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 NAXEQ8NCW5 288 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 AFAP1L1Q8TED9 768 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 GOLGA1Q92805 767 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 RILPL2Q969X0 211 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 PYGO2Q9BRQ0 406 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 CRACR2AQ9BSW2 395 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 CARD6Q9BX69 1037 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa3.19□□□□□ -1.9
PKIB-201ENST00000258014 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms