RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257604.9

TRAFD1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene TRAFD1, Length 3,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-201ENST00000257604 PARP15Q460N3 678 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 DNAL1Q4LDG9 190 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 SCML4Q8N228 414 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 CDH19Q9H159 772 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAFD1-201ENST00000257604 INSIG1O15503 277 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 NDUFS3O75489 264 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 NUDT2P50583 147 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 LIPMQ5VYY2 423 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 KLC3Q6P597 504 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CILP2Q8IUL8 1156 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 APBB2Q92870 758 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CNBD2Q96M20 576 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PREBQ9HCU5 417 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 TREX1Q9NSU2 369 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 MTRRQ9UBK8 725 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 FKBPLQ9UIM3 349 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 RAI2Q9Y5P3 530 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 A0A1B0GTW7 788 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 INPPL1O15357 1258 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SRP72O76094 671 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 VCLP18206 1134 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PKNOX1P55347 436 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ZXDBP98169 803 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CCNIQ14094 377 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ARTNQ5T4W7 220 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 BEND5Q7L4P6 421 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ZBTB46Q86UZ6 589 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PDSS2Q86YH6 399 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 HBEGFQ99075 208 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CWH43Q9H720 699 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SEPT3Q9UH03 358 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 AP3B1O00203 1094 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 LDB2O43679 373 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SERPINA6P08185 405 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 RPL14P50914 215 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 COPAP53621 1224 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 EPHB3P54753 998 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ADGRF1Q5T601 910 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 FRMD7Q6ZUT3 714 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SPRED2Q7Z698 418 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SNX32Q86XE0 403 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 FAM156AQ8NDB6 213 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PRAMEF12O95522 483 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CSKP41240 450 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 INHBCP55103 352 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PPP1R3AQ16821 1122 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 INSCQ1MX18 579 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 FBXL19Q6PCT2 694 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SPATA24Q86W54 205 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 NAT16Q8N8M0 369 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 OR4L1Q8NH43 312 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 IL1RL2Q9HB29 575 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CATSPERZQ9NTU4 200 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 UBXN8O00124 270 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 STX7O15400 261 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 TMCC1O94876 653 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 KLHL2O95198 593 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PTPRNQ16849 979 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 TMEM207Q6UWW9 146 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 APCDD1Q8J025 514 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 MKS1Q9NXB0 559 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 DNAH14Q0VDD8 3507 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SUPT3HB4E1H0 165 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SUPT3HO75486 399 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 GPC4O75487 556 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 RFPL2O75678 378 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 AGAP9Q5VTM2 703 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 AFMIDQ63HM1 303 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms