RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257290.9

PDGFRA-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRA, Length 6,576 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRA-201ENST00000257290 SERHLQ9NQF3 203 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 FAM20BO75063 409 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 QDPRP09417 244 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 OR52Z1P0C646 297 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 CYP11B1P15538 503 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 CYP3A5P20815 502 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC12A1Q13621 1099 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 PDK4Q16654 411 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 SGO1Q5FBB7 561 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 FOPNLQ96NB1 174 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 DCLK1O15075 740 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 USP17L8P0C7I0 530 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 CCNE1P24864 410 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 CDKN2CP42773 168 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 NPY2RP49146 381 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 CDK8P49336 464 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 IL5RAQ01344 420 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 TFDP1Q14186 410 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 KRT33BQ14525 404 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 CHI3L2Q15782 390 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 COLEC12Q5KU26 742 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 TDRPQ86YL5 185 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC22A9Q8IVM8 553 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 WDR26Q9H7D7 661 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 CES2O00748 559 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 AMPD1P23109 780 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 HPCAL1P37235 193 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 MAGEA11P43364 429 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 C21orf58P58505 322 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 NLRX1Q86UT6 975 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 IGFN1Q86VF2 1251 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 LINGO1Q96FE5 620 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 EGFL8Q99944 293 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 NAT9Q9BTE0 207 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 LRRC19Q9H756 370 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 PIM2Q9P1W9 311 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 NALCNQ8IZF0 1738 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 RGSL1A5PLK6 1076 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 L1CAMP32004 1257 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC25A3Q00325 362 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 AGAP6Q5VW22 663 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC43A2Q8N370 569 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 POF1BQ8WVV4 589 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 TLCD1Q96CP7 247 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 TXNDC15Q96J42 360 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 AGAP4Q96P64 663 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 RANBP9Q96S59 729 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 FETUBQ9UGM5 382 aa6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 A0A075B6Q4 140 aa6.74□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.74□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 PRAMEF10O60809 474 aa6.74□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 PRKCIP41743 596 aa6.74□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 GRIA2P42262 883 aa6.74□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 HERVK_113P62684 666 aa6.74□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 MAPK7Q13164 816 aa6.74□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 NAB2Q15742 525 aa6.74□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa6.74□□□□□ -1.33
PDGFRA-201ENST00000257290 ZBTB44Q8NCP5 570 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms