RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 SLC29A1Q99808 456 aa20.2■□□□□ 0.82
VGF-201ENST00000249330 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
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VGF-201ENST00000249330 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.2■□□□□ 0.82
VGF-201ENST00000249330 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.2■□□□□ 0.82
VGF-201ENST00000249330 RAD54BQ9Y620 910 aa20.2■□□□□ 0.82
VGF-201ENST00000249330 TRIM24O15164 1050 aa20.2■□□□□ 0.82
VGF-201ENST00000249330 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
VGF-201ENST00000249330 BMP10O95393 424 aa20.2■□□□□ 0.82
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VGF-201ENST00000249330 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
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VGF-201ENST00000249330 C10orf120Q5SQS8 335 aa20.19■□□□□ 0.82
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VGF-201ENST00000249330 BBS5Q8N3I7 341 aa20.18■□□□□ 0.82
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VGF-201ENST00000249330 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.18■□□□□ 0.82
VGF-201ENST00000249330 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
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VGF-201ENST00000249330 ZNF558Q96NG5 402 aa20.18■□□□□ 0.82
VGF-201ENST00000249330 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.18■□□□□ 0.82
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VGF-201ENST00000249330 PRORSD1PA6NEY8 169 aa20.17■□□□□ 0.82
VGF-201ENST00000249330 E9PAM4 449 aa20.17■□□□□ 0.82
VGF-201ENST00000249330 DFFAO00273 331 aa20.17■□□□□ 0.82
VGF-201ENST00000249330 AHSGP02765 367 aa20.17■□□□□ 0.82
VGF-201ENST00000249330 STMN1P16949 149 aa20.17■□□□□ 0.82
VGF-201ENST00000249330 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
VGF-201ENST00000249330 CDH15P55291 814 aa20.17■□□□□ 0.82
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