RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS13AQ96RL7 3174 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 POLBP06746 335 aa26.39■■□□□ 1.82
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CAPNS1-201ENST00000246533 ADH5P11766 374 aa26.39■■□□□ 1.82
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CAPNS1-201ENST00000246533 LAMB3Q13751 1172 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIP10Q15642 601 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF111Q6ZNA4 994 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa26.39■■□□□ 1.82
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CAPNS1-201ENST00000246533 POU5F2Q8N7G0 328 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1958Q8N8K9 716 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 OTUB2Q96DC9 234 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-201ENST00000246533 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa26.39■■□□□ 1.81
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
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CAPNS1-201ENST00000246533 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
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CAPNS1-201ENST00000246533 STAP1Q9ULZ2 295 aa26.38■■□□□ 1.81
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF510Q9Y2H8 683 aa26.37■■□□□ 1.81
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CAPNS1-201ENST00000246533 RAP1GAP2Q684P5 730 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 FSTL4Q6MZW2 842 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 PQLC1Q8N2U9 271 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
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