RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 ASGR1P07306 291 aa18.13■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 RGRP47804 291 aa18.13■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 KCNQ1P51787 676 aa18.13■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 TBX4P57082 545 aa18.13■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 MAP7Q14244 749 aa18.13■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 CHSY3Q70JA7 882 aa18.13■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 ARRDC2Q8TBH0 407 aa18.13■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 TMEM74Q96NL1 305 aa18.13■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 UNC93B1Q9H1C4 597 aa18.13■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 SPAG4Q9NPE6 437 aa18.13■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 RRN3Q9NYV6 651 aa18.13■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 ARHGEF37A1IGU5 675 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 KPNA6O60684 536 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 RPL5P46777 297 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 LPIN1Q14693 890 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 UGT3A1Q6NUS8 523 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 ADCY4Q8NFM4 1077 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 IRGQQ8WZA9 623 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 TUBGCP3Q96CW5 907 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 DTNBP1Q96EV8 351 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 CROTQ9UKG9 612 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 GIT1Q9Y2X7 761 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 CDC7O00311 574 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 PFDN1O60925 122 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 GFAPP14136 432 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 SLC5A2P31639 672 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 GATMP50440 423 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 UGT3A2Q3SY77 523 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 KLC3Q6P597 504 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 SERINC5Q86VE9 423 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 GIPC2Q8TF65 315 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 CCSER2Q9H7U1 834 aa18.12■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 IQCF5A8MTL0 148 aa18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 MAPK10P53779 464 aa18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 XIAPP98170 497 aa18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 PAQR3Q6TCH7 311 aa18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 OR7D4Q8NG98 312 aa18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 SPON2Q9BUD6 331 aa18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 SPO11Q9Y5K1 396 aa18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 OR1I1O60431 355 aa18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 MTHFD2P13995 350 aa18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 NDST2P52849 883 aa18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 RHDQ02161 417 aa18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 SQLEQ14534 574 aa18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 C10orf120Q5SQS8 335 aa18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 OFCC1Q8IZS5 231 aa18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 FAM47BQ8NA70 645 aa18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 MUC3BQ9H195 1237 aa18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP18.11■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 SLC12A8A0AV02 714 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 PSMD3O43242 534 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 SRP72O76094 671 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 BAIAP3O94812 1187 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 HGFP14210 728 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 ELNP15502 786 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 CD1DP15813 335 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 IMPDH1P20839 514 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 GPX3P22352 226 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 OR1E1P30953 314 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 FLT3LGP49771 235 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 STX5Q13190 355 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 HERC3Q15034 1050 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 TSNQ15631 228 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 KCNA10Q16322 511 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 BRMS1LQ5PSV4 323 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 ZFP1Q6P2D0 407 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 THEM5Q8N1Q8 247 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 CBR4Q8N4T8 237 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 TWIST2Q8WVJ9 160 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 BHMTQ93088 406 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 TBC1D13Q9NVG8 400 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 RAB26Q9ULW5 256 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 PHF24Q9UPV7 400 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 ASLP04424 464 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 SLC2A3P11169 496 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 HOXC13P31276 330 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 RPL9P32969 192 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 RENBPP51606 427 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 DNAJB13P59910 316 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 TUSC3Q13454 348 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 ACAP2Q15057 778 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 AFMIDQ63HM1 303 aa18.1■□□□□ 0.49
PANX1-201ENST00000227638 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms