RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 RTP4Q96DX8 246 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ACLYP53396 1101 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 FAAP100Q0VG06 881 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SMU1Q2TAY7 513 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TTMPQ5BVD1 217 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ADGRF1Q5T601 910 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SZRD1Q7Z422 152 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CCDC185Q8N715 623 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 APOL5Q9BWW9 433 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TAS2R14Q9NYV8 317 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PROX1Q92786 737 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TFR2Q9UP52 801 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.33□□□□□ -1.4
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SETX-201ENST00000224140 BGNP21810 368 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PTGIRP43119 386 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 RGS1Q08116 209 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MIPEPQ99797 713 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 OMDQ99983 421 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ZSCAN32Q9NX65 697 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PRKCHP24723 683 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PPARDQ03181 441 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CYP20A1Q6UW02 462 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SNX20Q7Z614 316 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ZNF347Q96SE7 839 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CD320Q9NPF0 282 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 VPS4AQ9UN37 437 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 B4GALT5O43286 388 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 GPR89BP0CG08 455 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 HRH2P25021 359 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 GPR17Q13304 367 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 AGKQ53H12 422 aa6.33□□□□□ -1.4
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SETX-201ENST00000224140 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ITFG1Q8TB96 612 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 USP29Q9HBJ7 922 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.33□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TLL1O43897 1013 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 C2P06681 752 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TALDO1P37837 337 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MTSS1LQ765P7 747 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TMEM245Q9H330 911 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 POMKQ9H5K3 350 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SNX7Q9UNH6 387 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 RCCD1A6NED2 376 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 AP2A2O94973 939 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 HPGDP15428 266 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ATP4BP51164 291 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SOWAHAQ2M3V2 549 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TBCELQ5QJ74 424 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
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SETX-201ENST00000224140 SVOPLQ8N434 492 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 HIC2Q96JB3 615 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 DTLQ9NZJ0 730 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CROCCQ5TZA2 2017 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MED26O95402 600 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 FGBP02675 491 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 RB1P06400 928 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CHRNB2P17787 502 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 NTSP30990 170 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SP140Q13342 867 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.32□□□□□ -1.4
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