RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222574.8

HBP1-201, Transcript of HMG-box transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HBP1, Length 2,829 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBP1-201ENST00000222574 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 ZNF534Q76KX8 674 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 ACDQ96AP0 544 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 MARK4Q96L34 752 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 C12orf42Q96LP6 360 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 ZNF175Q9Y473 711 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 MAGEB16A2A368 324 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 PDPK1O15530 556 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 HCRTO43612 131 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 ADAM11O75078 769 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 AMHP03971 560 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 SERPINA6P08185 405 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 PCSK2P16519 638 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 CASP3P42574 277 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 ACAP2Q15057 778 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 CDH26Q8IXH8 852 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 GALNT12Q8IXK2 581 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 PHF21AQ96BD5 680 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 C12orf57Q99622 126 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 NUP50Q9UKX7 468 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 RAD54BQ9Y620 910 aa14.93□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 PRSS44E7EML9 344 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 DYRK3O43781 588 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 SNNO75324 88 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 CCNKO75909 580 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 RNF224P0DH78 156 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 SFTPCP11686 197 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 DDCP20711 480 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 CYP3A5P20815 502 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 SERPINB5P36952 375 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 GPRASP2Q96D09 838 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 RNF157Q96PX1 679 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 PCYT2Q99447 389 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 Q9H521 79 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 CDH22Q9UJ99 828 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 SNX13Q9Y5W8 968 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 ARHGEF37A1IGU5 675 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 H0YJX3 145 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 PRPSAP2O60256 369 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 MSCO60682 206 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 KRT8P05787 483 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 MAJINQ3KP22 176 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 FRA10AC1Q70Z53 315 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 WDR49Q8IV35 697 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 REPS2Q8NFH8 660 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 TRIB2Q92519 343 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 FATE1Q969F0 183 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 RMND5AQ9H871 391 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 RSAD1Q9HA92 442 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 TMEM216Q9P0N5 145 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 SIX4Q9UIU6 781 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 POMPQ9Y244 141 aa14.92□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 RLFQ13129 1914 aa14.91□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.91□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 AIM2O14862 343 aa14.91□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 CFLARO15519 480 aa14.91□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 ZBTB14O43829 449 aa14.91□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 MAN1A2O60476 641 aa14.91□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 SERPINB1P30740 379 aa14.91□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 SCNN1GP51170 649 aa14.91□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 AKR1D1P51857 326 aa14.91□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 C1QTNF8P60827 252 aa14.91□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 SRP54P61011 504 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 XIAPP98170 497 aa14.91□□□□□ -0.02
HBP1-201ENST00000222574 DNAL1Q4LDG9 190 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms