RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006777.10

RHBDD2-201, Transcript of rhomboid domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RHBDD2, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2-201ENST00000006777 EML3Q32P44 896 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF549Q6P9A3 640 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 PNPLA1Q8N8W4 532 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 HEXDCQ8WVB3 486 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 LPGAT1Q92604 370 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ECHDC3Q96DC8 303 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 UBXN10Q96LJ8 280 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 LRRC3BQ96PB8 259 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 LRRC37BQ96QE4 947 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 C20orf27Q9GZN8 174 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 KCNK13Q9HB14 408 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 IGSF5Q9NSI5 407 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 KCNK4Q9NYG8 393 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 XPR1Q9UBH6 696 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 BPTFQ12830 3046 aa21.4■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 SBK3P0C264 359 aa21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ASPHQ12797 758 aa21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 PEX6Q13608 980 aa21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 CSHL1Q14406 222 aa21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 GALNTL6Q49A17 601 aa21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 LIPMQ5VYY2 423 aa21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 BPIFB1Q8TDL5 484 aa21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 SMARCD2Q92925 531 aa21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ASB16Q96NS5 453 aa21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 LYSMD1Q96S90 227 aa21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 CCDC68Q9H2F9 335 aa21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 SUV39H2Q9H5I1 410 aa21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 BPIFA1Q9NP55 256 aa21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 ERVW-1Q9UQF0 538 aa21.39■■□□□ 1.02
RHBDD2-201ENST00000006777 DNAJC6O75061 913 aa21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 UBOX5O94941 541 aa21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 RBP1P09455 135 aa21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 NNMTP40261 264 aa21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 VASPP50552 380 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 PTPRRQ15256 657 aa21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 FAM78AQ5JUQ0 283 aa21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 NAT16Q8N8M0 369 aa21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 RSPRY1Q96DX4 576 aa21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 OBP2AQ9NY56 170 aa21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 GDE1Q9NZC3 331 aa21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 PRDM4Q9UKN5 801 aa21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC12A4Q9UP95 1085 aa21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 PPIL1Q9Y3C6 166 aa21.39■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 WASH3PC4AMC7 463 aa21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 ITM2AO43736 263 aa21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 CCDC166P0CW27 439 aa21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 HNF1BP35680 557 aa21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 VIPR2P41587 438 aa21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 DGKGP49619 791 aa21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 XIAPP98170 497 aa21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 CACNG1Q06432 222 aa21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 ACAP2Q15057 778 aa21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 FGF13Q92913 245 aa21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 VOPP1Q96AW1 172 aa21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC8A2Q9UPR5 921 aa21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa21.38■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 EPOPA6NHQ4 379 aa21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 NFATC1O95644 943 aa21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 ASLP04424 464 aa21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 PRSS56P0CW18 603 aa21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 CDKN3Q16667 212 aa21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 SPRED3Q2MJR0 410 aa21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 TECRLQ5HYJ1 363 aa21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 SPDYAQ5MJ70 313 aa21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 TMEM215Q68D42 235 aa21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 GPR149Q86SP6 731 aa21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 STK40Q8N2I9 435 aa21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 EID2BQ96D98 161 aa21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 FAM96AQ9H5X1 160 aa21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa21.37■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 BNIP3LO60238 219 aa21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 FSBPO95073 299 aa21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 CISD3P0C7P0 127 aa21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 SCTRP47872 440 aa21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 BNIP1Q12981 228 aa21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 GEN1Q17RS7 908 aa21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa21.36■■□□□ 1.01
RHBDD2-201ENST00000006777 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms