RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fzd1O70421 642 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Camk4P08414 469 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RapsnP12672 412 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dpf3P58269 378 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ThraP63058 492 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prss53Q571E5 552 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr464Q5SW48 313 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mfsd3Q5U419 412 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr65Q61038 337 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nomo1Q6GQT9 1214 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Efr3bQ6ZQ18 817 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap26Q6ZQ82 814 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ric8bQ80XE1 520 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dyrk4Q8BI55 632 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc18a2Q8BRU6 517 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr847Q8VFF4 312 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gprc5bQ923Z0 410 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Haus8Q99L00 373 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndufb5Q9CQH3 189 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chit1Q9D7Q1 464 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grm3Q9QYS2 879 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Med20Q9R0X0 212 aa12.68□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl9-ps6A0A140T8T4 192 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem215A7E1Z1 235 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r111K7N674 857 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NmbrO54799 390 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Got2P05202 430 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il12bP43432 335 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl9P51410 192 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eml1Q05BC3 814 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plpp4Q0VBU9 271 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Enpp3Q6DYE8 874 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sel1l3Q80TS8 1137 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gabra5Q8BHJ7 463 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nup93Q8BJ71 819 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smoc1Q8BLY1 463 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gbp5Q8CFB4 590 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TwnkQ8CIW5 685 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GrpQ8R1I2 146 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl57Q9CQF8 102 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tma16Q9CR02 221 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serbp1Q9CY58 407 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ola1Q9CZ30 396 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kctd4Q9D7X1 259 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ampd2Q9DBT5 798 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NbnQ9R207 751 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ruvbl2Q9WTM5 463 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21964A0A1W2P7S4 437 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mkrn2osD3Z393 217 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Erich2E9Q1A6 463 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Impdh2P24547 514 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CidecP56198 239 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lcp1Q61233 627 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nqo1Q64669 274 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tigd3Q7TM95 470 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Casd1Q7TN73 797 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OsgepQ8BWU5 335 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cabcoco1Q8CDT7 208 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nkiras1Q8CEC5 192 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adprhl2Q8CG72 370 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1325Q8VF43 315 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DenrQ9CQJ6 198 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Echdc3Q9D7J9 300 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbc1d21Q9D9D3 336 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akr1e2Q9DCT1 301 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fiz1Q9WTJ4 500 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RecqlQ9Z129 648 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd320Q9Z1P5 260 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chek2Q9Z265 546 aa12.67□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f15A0A087WR44 498 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f12A0A0A0MQP3 498 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f9A2BFZ7 498 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f7A2BHG6 498 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f19A2CG71 498 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f10A2CG92 498 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f3A2CGC2 496 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f13B8JKF6 498 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r96E9PZU5 664 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f2J3QMS5 498 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f25J3QMV9 498 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f6J3QMW9 498 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f26J3QNK2 498 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f24J3QNQ5 498 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f8J3QQ50 498 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f17L7MU81 498 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f18L7MU83 498 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm7942L7N277 499 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cldn2O88552 230 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gabpb1Q00420 383 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f14Q1LZI5 498 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc22a16Q497L8 649 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2-Q2Q4KN81 360 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim67Q505D9 768 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f27Q5FWA1 498 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Frem3Q5H8B9 2123 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif2b4Q61749 524 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cox8aQ64445 69 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Deup1Q7M6Y5 601 aa12.66□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cndp1Q8BUG2 492 aa12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.2 ms