RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TARDBP-231	ENST00000639599	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	LRCH4	O75427	683 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	SERPINC1	P01008	464 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	ALDH4A1	P30038	563 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	PCK1	P35558	622 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	GNPDA1	P46926	289 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	EPHB1	P54762	984 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	TPM4	P67936	248 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	ITK	Q08881	620 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	BOLA3	Q53S33	107 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	TTC9	Q92623	222 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM117A	Q9C073	453 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	CDH19	Q9H159	772 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599		B8ZZF3	427 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC28A2	O43868	658 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	NOBOX	O60393	691 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	CPNE6	O95741	557 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	CCNB1	P14635	433 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	ITIH1	P19827	911 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	CA4	P22748	312 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIM23	P36406	574 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	MMP13	P45452	471 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	DPYS	Q14117	519 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	NCAPH	Q15003	741 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	CNGA3	Q16281	694 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	MARC1	Q5VT66	337 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	DOK6	Q6PKX4	331 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	PCSK4	Q6UW60	755 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	SGF29	Q96ES7	293 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	LGR4	Q9BXB1	951 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	PSMD11	O00231	422 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	CD82	P27701	267 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	ETV3	P41162	512 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	GPR1	P46091	355 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	ATP1A2	P50993	1020 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	CDH6	P55285	790 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	MAX	P61244	160 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	CDK3	Q00526	305 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	DPYSL2	Q16555	572 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	USP7	Q93009	1102 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	DTD2	Q96FN9	168 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	COQ10A	Q96MF6	247 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIM7	Q9C029	511 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	ITPR1	Q14643	2758 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A1W2PQC6	194 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	PRAMEF10	O60809	474 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	PYGL	P06737	847 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	AMPD1	P23109	780 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	ACTR1B	P42025	376 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	ACTR1A	P61163	376 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	TGIF1	Q15583	401 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	KCTD16	Q68DU8	428 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	MGME1	Q9BQP7	344 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	SYT11	Q9BT88	431 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	RDH14	Q9HBH5	336 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	NOD2	Q9HC29	1040 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TARDBP-231	ENST00000639599	NT5M	Q9NPB1	228 aa		14.67	□□□□□ -0.06

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