RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 HDAC11Q96DB2 347 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 SNX27Q96L92 541 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TRIM15Q9C019 465 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 USP22Q9UPT9 525 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 CLDN5O00501 218 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TSPAN1O60635 241 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 CPB1P15086 417 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 JAK1P23458 1154 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ADRA1BP35368 520 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 STX1BP61266 288 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 AQP6Q13520 282 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 CHST13Q8NET6 341 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 MUS81Q96NY9 551 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ALPK1Q96QP1 1244 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TUBA1CQ9BQE3 449 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 C1orf50Q9BV19 199 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 RMI1Q9H9A7 625 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 SACM1LQ9NTJ5 587 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 PKD2L2Q9NZM6 624 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 DAPK2Q9UIK4 370 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 AKT3Q9Y243 479 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ST14Q9Y5Y6 855 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 CPQQ9Y646 472 aa20.53■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TCRBV5S2A0A599 114 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 PPP6CO00743 305 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 AXIN1O15169 862 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 TGFB3P10600 412 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 CD151P48509 253 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 SPCS2Q15005 226 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 PERM1Q5SV97 790 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD49Q8WVL7 239 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 HACD3Q9P035 362 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 DSEQ9UL01 958 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 NRCAMQ92823 1304 aa20.52■□□□□ 0.88
PMS1-222ENST00000639501 A0A087X1B8 175 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 AQP9O43315 295 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 ACADSBP45954 432 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 KCNC1P48547 511 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 GRB7Q14451 532 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 OXA1LQ15070 435 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 BCL2A1Q16548 175 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 RABL3Q5HYI8 236 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 PCID2Q5JVF3 399 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 DLK2Q6UY11 383 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 ITIH5Q86UX2 942 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 UNC93AQ86WB7 457 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 IPMKQ8NFU5 416 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 DPF3Q92784 378 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 WNT8BQ93098 351 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 SLC30A3Q99726 388 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 MRGBPQ9NV56 204 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 VWA7Q9Y334 891 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 TMED5Q9Y3A6 229 aa20.52■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 SPTLC1O15269 473 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 C7P10643 843 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 CHRNA4P43681 627 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 CDH13P55290 713 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 ABHD11Q8NFV4 315 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 HSFY1Q96LI6 401 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 SNTG2Q9NY99 539 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 PSME2Q9UL46 239 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 MCM3APO60318 1980 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 FYNP06241 537 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 ATP4BP51164 291 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 BNIP2Q12982 314 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 CADM3Q8N126 398 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.51■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 BBIP1A8MTZ0 92 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 SOCS7O14512 581 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 SUPT7LO94864 414 aa20.5■□□□□ 0.87
PMS1-222ENST00000639501 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms