RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635538.1

EP300-208, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 2

Gene EP300, Length 318 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-208	ENST00000635538	NTRK2	Q16620	822 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	TRIB2	Q92519	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538		A0A1W2PQ09	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	SOCS2	O14508	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	LDB2	O43679	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	BEST1	O76090	585 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	CYP1A2	P05177	515 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	AKR1B1	P15121	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	IL7R	P16871	459 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	HIST1H2AD	P20671	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	PRCP	P42785	496 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	LMAN1	P49257	510 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	CAMP	P49913	170 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	GALC	P54803	685 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	C21orf58	P58505	322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	IRF3	Q14653	427 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	PIM3	Q86V86	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	IFNL4	K9M1U5	179 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	ASAP2	O43150	1006 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	ITM2A	O43736	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	GPC4	O75487	556 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	SOX30	O94993	753 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	NAGA	P17050	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	MAOA	P21397	527 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	PON1	P27169	355 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	SLC15A1	P46059	708 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	MFAP4	P55083	255 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	P2RX3	P56373	397 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	TAS2R40	P59535	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	BECN1	Q14457	450 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	MTSS1L	Q765P7	747 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	DPPA4	Q7L190	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	POC5	Q8NA72	575 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	LRFN5	Q96NI6	719 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	OR2A14	Q96R47	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	COPG2	Q9UBF2	871 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EP300-208	ENST00000635538		H0YGN5	161 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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