RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631044.2

POLG-213, Transcript of DNA polymerase gamma, catalytic subunit, human

TSL 5

Gene POLG, Length 4,668 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLG-213	ENST00000631044	PHLPP1	O60346	1717 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	AURKA	O14965	403 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	NFIC	P08651	508 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	MLN	P12872	115 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	C4BPB	P20851	252 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	FMO4	P31512	558 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	OXCT1	P55809	520 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	RAB39A	Q14964	217 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	ZNF544	Q6NX49	715 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	MYDGF	Q969H8	173 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044		H3BNH8	94 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	CD97	P48960	835 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	OR2B6	P58173	313 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	RFX4	Q33E94	735 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	MBLAC2	Q68D91	279 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	PROSER1	Q86XN7	944 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	ZNF222	Q9UK12	451 aa		13.43	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	PLOD3	O60568	738 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	ITIH1	P19827	911 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	SLC16A1	P53985	500 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	ANGPT1	Q15389	498 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	ABI1	Q8IZP0	508 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	DAW1	Q8N136	415 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	ING3	Q9NXR8	418 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	TIMM22	Q9Y584	194 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	C2orf81	A6NN90	581 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	MYL12B	O14950	172 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	FGFR1	P11362	822 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	ARHGEF7	Q14155	803 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	SYT16	Q17RD7	645 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	PORCN	Q9H237	461 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	COL20A1	Q9P218	1284 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	PTPRA	P18433	802 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	MPP1	Q00013	466 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	MARC1	Q5VT66	337 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	CHSY3	Q70JA7	882 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	BIRC8	Q96P09	236 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	VAT1	Q99536	393 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	SERHL	Q9NQF3	203 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	DIABLO	Q9NR28	239 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	RIPK3	Q9Y572	518 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	ILVBL	A1L0T0	632 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	RFPL1	O75677	317 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	GSTM1	P09488	218 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	EPGN	Q6UW88	154 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		13.42	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		13.41	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		13.41	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	ADM5	C9JUS6	153 aa		13.41	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	NTRK1	P04629	796 aa		13.41	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	BNC1	Q01954	994 aa		13.41	□□□□□ -0.26
POLG-213	ENST00000631044	CEACAM7	Q14002	265 aa		13.41	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms