RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFRSF4P43489 277 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 USP45Q70EL2 814 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR150Q8NGU9 434 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 DKK3Q9UBP4 350 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 BPTFQ12830 3046 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 H7C0S8 307 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 CTHP32929 405 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 HADHAP40939 763 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 MPP1Q00013 466 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC18A2Q05940 514 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 ENPP2Q13822 863 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 LEXMQ3ZCV2 418 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF805Q5CZA5 627 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 TXNDC11Q6PKC3 985 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 TPRG1Q6ZUI0 275 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 GALNT7Q86SF2 657 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 CILP2Q8IUL8 1156 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 STK40Q8N2I9 435 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4L1Q8NH43 312 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 DNASE1L2Q92874 299 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 SGSM3Q96HU1 749 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 ACOX2Q99424 681 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 RHOJQ9H4E5 214 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM120BA0PK00 339 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 K7EQS6 105 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.585e-9■□□□□ 8.4
CAPNS1-215ENST00000628018 PRNPP04156 253 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 FSTL4Q6MZW2 842 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 AFTPHQ6ULP2 937 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 CRTC1Q6UUV9 634 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 TMIEQ8NEW7 156 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 MDM1Q8TC05 714 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8D1Q8WZ84 308 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS39Q96JC1 886 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 BPIFA1Q9NP55 256 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNK9Q9NPC2 374 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 SUN2Q9UH99 717 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 PKP3Q9Y446 797 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-215ENST00000628018 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 TYROBPO43914 113 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 CLDN7O95471 211 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC18A1P54219 525 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 MPP2Q14168 576 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 E2F5Q15329 346 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 DEFB123Q8N688 67 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 BANPQ8N9N5 519 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 ISL2Q96A47 359 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM129BQ96TA1 746 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 FKBPLQ9UIM3 349 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 SARDHQ9UL12 918 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 PPM1HQ9ULR3 514 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 UNC80Q8N2C7 3258 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 SCN8AQ9UQD0 1980 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA8RI6L899 631 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 NPC1O15118 1278 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 SPAG7O75391 227 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 PYGBP11216 843 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 TIMP2P16035 220 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 CCNFP41002 786 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 PPARDQ03181 441 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 MRNIPQ6NTE8 343 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPAN33Q86UF1 283 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 DCLK2Q8N568 766 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR22Q99680 433 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 HEBP1Q9NRV9 189 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 CATSPERZQ9NTU4 200 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 STON1Q9Y6Q2 735 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 PIAS3Q9Y6X2 628 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 HAUS5O94927 633 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 CHN1P15882 459 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 MDH1P40925 334 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCG1P45844 678 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 CD151P48509 253 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 PEX6Q13608 980 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 OTUD6BQ8N6M0 293 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS16Q9NQE7 514 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 B4GALT6Q9UBX8 382 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM47DPA6NHR8 397 aa24.86■■□□□ 1.57
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