RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	CHST8	Q9H2A9	424 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	OSER1	Q9NX31	292 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	MED29	Q9NX70	200 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	ATP8B3	O60423	1300 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM187A	A6NFU0	413 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	CFAP99	D6REC4	459 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM227A	F5H4B4	570 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	BNIP3L	O60238	219 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	TBL1X	O60907	577 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	WISP2	O76076	250 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	PDGFRB	P09619	1106 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	PEX5	P50542	639 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	SLFN5	Q08AF3	891 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	STRN3	Q13033	797 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	NFATC4	Q14934	902 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	POU4F3	Q15319	338 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	ACCSL	Q4AC99	568 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	AWAT1	Q58HT5	328 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	ELOA3	Q8NG57	546 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	ASB12	Q8WXK4	309 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	RNF34	Q969K3	372 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	TNIP3	Q96KP6	325 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	KCNK16	Q96T55	309 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC38A3	Q99624	504 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	NLN	Q9BYT8	704 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	C2CD2	Q9Y426	696 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	DYTN	A2CJ06	578 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	CLDN5	O00501	218 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	PRC1	O43663	620 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC37A4	O43826	429 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	ADRB2	P07550	413 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	CYP11B2	P19099	503 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	HNF1A	P20823	631 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	SEPHS1	P49903	392 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	SGSH	P51688	502 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	NEK3	P51956	506 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	CASP9	P55211	416 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	CACNG1	Q06432	222 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	QPCT	Q16769	361 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	FRS2	Q8WU20	508 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	PATE1	Q8WXA2	126 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	KIFAP3	Q92845	792 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	EVI5L	Q96CN4	794 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	LMLN	Q96KR4	655 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	HDAC8	Q9BY41	377 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	POLD4	Q9HCU8	107 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1W2PQH9	124 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061		O00370	1275 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	FGF1	P05230	155 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	RALA	P11233	206 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	FPR1	P21462	350 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	TACR1	P25103	407 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	UQCRC1	P31930	480 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	MAPK9	P45984	424 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	CTSC	P53634	463 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	PEX3	P56589	373 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	EFEMP1	Q12805	493 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	MFAP5	Q13361	173 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	CDH18	Q13634	790 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	CYP2A13	Q16696	494 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-222	ENST00000626061	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		6.22	□□□□□ -1.41

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