RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	GPAM	Q9HCL2	828 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	USP18	Q9UMW8	372 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	CACNA1E	Q15878	2313 aa		7.27	□□□□□ -1.24
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	TLDC2	A0PJX2	215 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PRRT4	C9JH25	899 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	HAT1	O14929	419 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	DCLK1	O15075	740 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	CHAD	O15335	359 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PHF2	O75151	1096 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	LRIG2	O94898	1065 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	CHEK2	O96017	543 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	KRT6A	P02538	564 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	KRT6B	P04259	564 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	AMPD1	P23109	780 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	IL1R2	P27930	398 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	HLA-F	P30511	346 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	DGKE	P52429	567 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	MTM1	Q13496	603 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	APCDD1	Q8J025	514 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	FRMD1	Q8N878	549 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	GLMN	Q92990	594 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC138	Q96M89	665 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	BTBD9	Q96Q07	612 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	HAUS8	Q9BT25	410 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	RRN3	Q9NYV6	651 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495		R4GN57	208 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM186A	A6NE01	2351 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM120B	A0PK00	339 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PLK4	O00444	970 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	GSC2	O15499	205 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	AQP9	O43315	295 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	SH3BP5	O60239	455 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	LRCH4	O75427	683 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	ECI2	O75521	394 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	DAB1	O75553	588 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	FKBP9	O95302	570 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	CRYZL1	O95825	349 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	MT-CO1	P00395	513 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	KRT1	P04264	644 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	M6PR	P20645	277 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	COMT	P21964	271 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PRKCI	P41743	596 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	TAS2R40	P59535	323 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC7A9	P82251	487 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PTP4A2	Q12974	167 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PDK3	Q15120	406 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP2R5E	Q16537	467 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	RASSF3	Q86WH2	238 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	SPART	Q8N0X7	666 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	SNX19	Q92543	992 aa		7.27	□□□□□ -1.25
LETMD1-238	ENST00000623495	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		7.27	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms