RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 TEX33O43247 280 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 FGF1P05230 155 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 CCL4P13236 92 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 ERCC2P18074 760 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 PSMA2P25787 234 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 ALDH4A1P30038 563 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 COPB1P53618 953 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 OR1D5P58170 312 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 AP1S1P61966 158 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP4F2P78329 520 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 IL10RBQ08334 325 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 AMZ1Q400G9 498 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 ERMARDQ5T6L9 678 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM164Q5U3C3 297 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 ACAD10Q6JQN1 1059 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 RFX8Q6ZV50 586 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 HEATR4Q86WZ0 1026 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 NRROSQ86YC3 692 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 NPWQ8N729 165 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 PAF1Q8N7H5 531 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 NUS1Q96E22 293 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 PSKH2Q96QS6 385 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 PEBP4Q96S96 227 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 NUDT22Q9BRQ3 303 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 FUCA2Q9BTY2 467 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 TEX101Q9BY14 249 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 GSDMCQ9BYG8 508 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 FANCLQ9NW38 375 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 TAAR2Q9P1P5 351 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 B4GALT6Q9UBX8 382 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 SEPT3Q9UH03 358 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 LGALS16A8MUM7 142 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 STMND1H3BQB6 276 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 DFFAO00273 331 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 ZW10O43264 779 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 DAPK3O43293 454 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 PPFIA2O75334 1257 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 ECEL1O95672 775 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 FUCA1P04066 466 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 CEACAM5P06731 702 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 AK4P27144 223 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR3P46089 330 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 RENBPP51606 427 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 ARSDP51689 593 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 CDK3Q00526 305 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 MAMLD1Q13495 774 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 LBRQ14739 615 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 CNGA3Q16281 694 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 TMCO4Q5TGY1 634 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 RCBTB1Q8NDN9 531 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC74BQ96LY2 380 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 TAAR9Q96RI9 348 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 ERGIC2Q96RQ1 377 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC25A18Q9H1K4 315 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 KCTD5Q9NXV2 234 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 TAS2R14Q9NYV8 317 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 CHMP5Q9NZZ3 219 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 PCSK1NQ9UHG2 260 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 SUFUQ9UMX1 484 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 ST14Q9Y5Y6 855 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 NAV2Q8IVL1 2488 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1W2PQ67 120 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 SOCS5O75159 536 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC172P0C7W6 258 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 CR2P20023 1033 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 LHCGRP22888 699 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 CD1CP29017 333 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 VIPR1P32241 457 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 GNPDA1P46926 289 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 HCAR3P49019 387 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP1A2P50993 1020 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 LIMK2P53671 638 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 UBXN1Q04323 297 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC10A7Q0GE19 358 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-226ENST00000593200 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms