RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF438Q7Z4V0 828 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PIM3Q86V86 326 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 NUS1Q96E22 293 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT22Q9BRQ3 303 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 IL17BQ9UHF5 180 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 TERTO14746 1132 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 DAPK3O43293 454 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 FGF1P05230 155 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 CD82P27701 267 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 AP1S1P61966 158 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 CNGA3Q16281 694 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ERMARDQ5T6L9 678 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 HEATR4Q86WZ0 1026 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 RCBTB1Q8NDN9 531 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PSKH2Q96QS6 385 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 CEACAM5P06731 702 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 AK4P27144 223 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ALDH4A1P30038 563 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 UBXN1Q04323 297 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC10A7Q0GE19 358 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 NR1D2Q14995 579 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PMEPA1Q969W9 287 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ERGIC2Q96RQ1 377 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 SYT11Q9BT88 431 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 FUCA2Q9BTY2 467 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX101Q9BY14 249 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 GSDMCQ9BYG8 508 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 TAAR2Q9P1P5 351 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 SEPT3Q9UH03 358 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ST14Q9Y5Y6 855 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 RHPN2P1A8MT19 583 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ECEL1O95672 775 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ARSDP51689 593 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 LBRQ14739 615 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PATE1Q8WXA2 126 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 SPOCK2Q92563 424 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC74BQ96LY2 380 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM7Q9C029 511 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GNT4Q9C0J1 378 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 PARVAQ9NVD7 372 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 SUFUQ9UMX1 484 aa25.64■■□□□ 1.7
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 TMCO5BA8MYB1 307 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 SUV39H1O43463 412 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 FERP16591 822 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 LHCGRP22888 699 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 CD1CP29017 333 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 VIPR1P32241 457 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 GNPDA1P46926 289 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK3Q00526 305 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 CLCA4Q14CN2 919 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 TMCO4Q5TGY1 634 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM164Q5U3C3 297 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 DENND2CQ68D51 928 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC30A9Q6PML9 568 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 ATG14Q6ZNE5 492 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 SEMA3CQ99985 751 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 BSNQ9UPA5 3926 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 UNC13CQ8NB66 2214 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 HGSO14964 777 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 MIPP30301 263 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 ETV3P41162 512 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 RENBPP51606 427 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 DPYSQ14117 519 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 PGBD5Q8N414 524 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 DTD2Q96FN9 168 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM191CA6NGB0 347 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 STMND1H3BQB6 276 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 PEX11BO96011 259 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 CPP00450 1065 aa25.61■■□□□ 1.69
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