RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 STAT1P42224 750 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 SUOXP51687 545 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 CTBSQ01459 385 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 KLRB1Q12918 225 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 SNAP47Q5SQN1 464 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 AFMIDQ63HM1 303 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 ERAP2Q6P179 960 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 ARCQ7LC44 396 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 DNAAF5Q86Y56 855 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 SLC30A5Q8TAD4 765 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 KIAA1524Q8TCG1 905 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 FAM172AQ8WUF8 416 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 STARD8Q92502 1023 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 ECHDC3Q96DC8 303 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 FAM81BQ96LP2 452 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 WDR26Q9H7D7 661 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 SUFUQ9UMX1 484 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 KCNMB2Q9Y691 235 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 A1L4Q6 167 aa16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 B4E171 279 aa16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 CHRNB2P17787 502 aa16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 EPHB2P29323 1055 aa16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 TSPAN7P41732 249 aa16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 PTP4A2Q12974 167 aa16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 SQSTM1Q13501 440 aa16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 DCAF12Q5T6F0 453 aa16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF787Q6DD87 383 aa16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 RFLNAQ6ZTI6 216 aa16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 DPPA4Q7L190 304 aa16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 HEATR4Q86WZ0 1026 aa16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 NLGN4XQ8N0W4 816 aa16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 FNIP1Q8TF40 1166 aa16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 COQ10AQ96MF6 247 aa16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 PDP2Q9P2J9 529 aa16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 SHANK1Q9Y566 2161 aa16■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 ELFN1P0C7U0 828 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF28P17035 718 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 TNFAIP3P21580 790 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 ADCY8P40145 1251 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 GPR3P46089 330 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 MC2RQ01718 297 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 RAPGEF1Q13905 1077 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 ACOX1Q15067 660 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM71Q6P5X7 295 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 BRAT1Q6PJG6 821 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 STRADAQ7RTN6 431 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 SRLQ86TD4 932 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 TP53INP2Q8IXH6 220 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 EPS8L1Q8TE68 723 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 TEX101Q9BY14 249 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 GSDMCQ9BYG8 508 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 LRRC19Q9H756 370 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 B4GALT6Q9UBX8 382 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 ITPR2Q14571 2701 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 CFAP69A5D8W1 941 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 WASH4PA8MWX3 477 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 CREB3O43889 395 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 STK17BO94768 372 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 DLGAP3O95886 979 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 KELP23276 732 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 SDC4P31431 198 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 PTPN9P43378 593 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 CNGA3Q16281 694 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 MIIPQ5JXC2 388 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 NTAN1Q96AB6 310 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 SMIM14Q96QK8 99 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 C11orf70Q9BRQ4 267 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 SLC39A8Q9C0K1 460 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 RETREG1Q9H6L5 497 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 PRAMEF11O60813 436 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 DNAJB5O75953 348 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 AGFG2O95081 481 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRS-208ENST00000590509 TCN2P20062 427 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms