RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 HK3P52790 923 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SRP54P61011 504 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 DSC2Q02487 901 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 NFATC4Q14934 902 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 AGERQ15109 404 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 LLGL1Q15334 1064 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 CDKN3Q16667 212 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ALG11Q2TAA5 492 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC38Q5VT99 294 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 KAZNQ674X7 775 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PNCKQ6P2M8 343 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC170Q8IYT3 715 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 PLA2G15Q8NCC3 412 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 FAF2Q96CS3 445 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 HDAC11Q96DB2 347 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 NUS1Q96E22 293 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SCRN2Q96FV2 425 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 WDR92Q96MX6 357 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 TSGA13Q96PP4 275 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 LGMNQ99538 433 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 DTLQ9NZJ0 730 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 GULP1Q9UBP9 304 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 AMACRQ9UHK6 382 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SALL4Q9UJQ4 1053 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 CLCA2Q9UQC9 943 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 CHKBQ9Y259 395 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 AK5Q9Y6K8 562 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-214ENST00000583153 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 LMO7DNF2Z398 122 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 YY2O15391 372 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 GCATO75600 419 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 HLA-DQB2P05538 268 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PDHA1P08559 390 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 GIMD1P0DJR0 217 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ETV3P41162 512 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CYP4F3Q08477 520 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 TFDP2Q14188 446 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PDK1Q15118 436 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 TCEAL1Q15170 157 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PTPRRQ15256 657 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ELOCQ15369 112 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 NR0B2Q15466 257 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CNGA3Q16281 694 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 RAET1GQ6H3X3 334 aa8.33□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 GKN2Q86XP6 184 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 TMTC1Q8IUR5 882 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC50Q8IVM0 306 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PLD5Q8N7P1 536 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 FAM181AQ8N9Y4 354 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 LPCAT1Q8NF37 534 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 OR56A4Q8NGH8 313 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 MDM1Q8TC05 714 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 IFI44Q8TCB0 444 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 MAPK15Q8TD08 544 aa8.33□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa8.33□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 PANX2Q96RD6 677 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC61Q9BV99 259 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 WDR26Q9H7D7 661 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 USP29Q9HBJ7 922 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PCDH9Q9HC56 1237 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 KCTD5Q9NXV2 234 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 OGFRQ9NZT2 677 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 TFR2Q9UP52 801 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ALG6Q9Y672 507 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ITPR1Q14643 2758 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 APC2O95996 2303 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0U1RQS6 177 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM202A6NGA9 273 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF487B1APH4 448 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PSMD11O00231 422 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 OPA1O60313 960 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CST8O60676 142 aa8.32□□□□□ -1.08
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