RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 DKK4Q9UBT3 224 aa17.12■□□□□ 0.33
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa17.11■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A0J9YYE9 177 aa17.11■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 BTNL10A8MVZ5 291 aa17.11■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 A8MX80 341 aa17.11■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNK1O00180 336 aa17.11■□□□□ 0.33
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PLA2G15Q8NCC3 412 aa17.11■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR56A4Q8NGH8 313 aa17.11■□□□□ 0.33
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CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDH9Q9HC56 1237 aa17.11■□□□□ 0.33
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CCNDBP1-211ENST00000567434 SOWAHDA6NJG2 315 aa17.1■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTSS1O43312 755 aa17.1■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 GCATO75600 419 aa17.1■□□□□ 0.33
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CCNDBP1-211ENST00000567434 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
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CCNDBP1-211ENST00000567434 DEFB133Q30KQ1 61 aa17.1■□□□□ 0.33
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CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF765Q7L2R6 523 aa17.1■□□□□ 0.33
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CCNDBP1-211ENST00000567434 U3KQA8 63 aa17.1■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 KNTC1P50748 2209 aa17.09■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRLP01236 227 aa17.09■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNFP01375 233 aa17.09■□□□□ 0.33
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CCNDBP1-211ENST00000567434 ETV3P41162 512 aa17.09■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 COPS2P61201 443 aa17.09■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 DYNLT1P63172 113 aa17.09■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 NIPAL4Q0D2K0 466 aa17.09■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBTB17Q13105 803 aa17.09■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 NR0B2Q15466 257 aa17.09■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRC66Q68CR7 880 aa17.09■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 CRTC1Q6UUV9 634 aa17.09■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa17.09■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 NLRP8Q86W28 1048 aa17.09■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 CNTD1Q8N815 330 aa17.09■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 NAT6Q93015 286 aa17.09■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
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CCNDBP1-211ENST00000567434 TEX101Q9BY14 249 aa17.09■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLPBQ9H078 707 aa17.09■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 LHX6Q9UPM6 363 aa17.09■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHKBQ9Y259 395 aa17.09■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRP4O75096 1905 aa17.09■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM149AA5PLN7 773 aa17.08■□□□□ 0.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 YY2O15391 372 aa17.08■□□□□ 0.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 OPA1O60313 960 aa17.08■□□□□ 0.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 CST8O60676 142 aa17.08■□□□□ 0.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 MMP2P08253 660 aa17.08■□□□□ 0.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTPS1P17812 591 aa17.08■□□□□ 0.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD86P42081 329 aa17.08■□□□□ 0.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 SKOR1P84550 965 aa17.08■□□□□ 0.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 C1orf61Q13536 156 aa17.08■□□□□ 0.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 IHHQ14623 411 aa17.08■□□□□ 0.32
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
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