RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567264.1

UBFD1-208, Transcript of ubiquitin family domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene UBFD1, Length 642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1-208ENST00000567264 COQ6Q9Y2Z9 468 aa22.71■■□□□ 1.23
UBFD1-208ENST00000567264 C2orf81A6NN90 581 aa22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 C10orf142B7Z368 130 aa22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 SLU7O95391 586 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 C1SP09871 688 aa22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 NPY2RP49146 381 aa22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 GUCY2DQ02846 1103 aa22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 PTSQ03393 145 aa22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 SEPT6Q14141 434 aa22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 WDR45BQ5MNZ6 344 aa22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 LYSMD4Q5XG99 296 aa22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 ZNF534Q76KX8 674 aa22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 ASB12Q8WXK4 309 aa22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 COQ10AQ96MF6 247 aa22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 SERPINB12Q96P63 405 aa22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 KCTD5Q9NXV2 234 aa22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 RAB23Q9ULC3 237 aa22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 DMTF1Q9Y222 760 aa22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.7■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 TRPM6Q9BX84 2022 aa22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 GOLGA8CPA6NN73 597 aa22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 WNT9AO14904 365 aa22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 AURKAO14965 403 aa22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 SLC31A1O15431 190 aa22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 PTGER3P43115 390 aa22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 DRG2P55039 364 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 PDE1BQ01064 536 aa22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 LAMB3Q13751 1172 aa22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 TEX35Q5T0J7 233 aa22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 CERCAMQ5T4B2 595 aa22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 RGL4Q8IZJ4 473 aa22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 TTC30BQ8N4P2 665 aa22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 HINFPQ9BQA5 517 aa22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 IL22Q9GZX6 179 aa22.69■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 A0A1W2PPC4 97 aa22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 STX7O15400 261 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 LPOP22079 712 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 CD27P26842 260 aa22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 HMGCLP35914 325 aa22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 ETV3P41162 512 aa22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 CAV1Q03135 178 aa22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 FGL2Q14314 439 aa22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 Q6ZVL8 140 aa22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 ABCA7Q8IZY2 2146 aa22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 NUS1Q96E22 293 aa22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 DTD2Q96FN9 168 aa22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 EPC1Q9H2F5 836 aa22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 EPB41L5Q9HCM4 733 aa22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 RAD18Q9NS91 495 aa22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 PKP3Q9Y446 797 aa22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 ARL5AQ9Y689 179 aa22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 THADAQ6YHU6 1953 aa22.68■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 FANCMQ8IYD8 2048 aa22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 HEATR9A2RTY3 570 aa22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 RGSL1A5PLK6 1076 aa22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 ADRA1DP25100 572 aa22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 MGAT1P26572 445 aa22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 AKT2P31751 481 aa22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 SPINT3P49223 89 aa22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 CREB5Q02930 508 aa22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 MTM1Q13496 603 aa22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 AGERQ15109 404 aa22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 CYP2U1Q7Z449 544 aa22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 NRSN1Q8IZ57 195 aa22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 DENND6BQ8NEG7 585 aa22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 RANBP9Q96S59 729 aa22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 CEP192Q8TEP8 1941 aa22.67■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 ESYT3A0FGR9 886 aa22.66■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa22.66■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 BUD23O43709 281 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 AVILO75366 819 aa22.66■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.66■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 GM2AP17900 193 aa22.66■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 MAOBP27338 520 aa22.66■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 TUBB4BP68371 445 aa22.66■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 LRRC14Q15048 493 aa22.66■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 LPAL2Q16609 132 aa22.66■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 CCDC38Q502W7 563 aa22.66■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
UBFD1-208ENST00000567264 PCID2Q5JVF3 399 aa22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms