RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	GMIP	Q9P107	970 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PLXNA3	P51805	1871 aa		18.43	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PSMC3	P17980	439 aa		18.42	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	YWHAQ	P27348	245 aa		18.42	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	KCNC1	P48547	511 aa		18.42	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	MAPKAPK2	P49137	400 aa		18.42	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	SERINC3	Q13530	473 aa		18.42	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		18.42	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	FBXL22	Q6P050	247 aa		18.42	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF597	Q96LX8	424 aa		18.42	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	TBATA	Q96M53	351 aa		18.42	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	IL37	Q9NZH6	218 aa		18.42	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		18.42	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		18.42	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	HUNK	P57058	714 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	MYBPC1	Q00872	1141 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	IHH	Q14623	411 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PIM3	Q86V86	326 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	DHFR2	Q86XF0	187 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PTER	Q96BW5	349 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	SEMA3C	Q99985	751 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	FAM92A	A1XBS5	289 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	EOMES	O95936	686 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	GPX3	P22352	226 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	CDKL1	Q00532	357 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	RALGDS	Q12967	914 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF235	Q14590	738 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PGBD5	Q8N414	524 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	IGSF8	Q969P0	613 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	APPL1	Q9UKG1	709 aa		18.41	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	CCL22	O00626	93 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	AZIN1	O14977	448 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	SLC4A1	P02730	911 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	HDC	P19113	662 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	NAA20	P61599	178 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	SH3BP2	P78314	561 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	DSC1	Q08554	894 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	KIF19	Q2TAC6	998 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	FAM26D	Q5JW98	314 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF599	Q96NL3	588 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM15	Q9C019	465 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	KCTD3	Q9Y597	815 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	OR51F1	A6NGY5	319 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PRAMEF11	O60813	436 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	VPS4B	O75351	444 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6AP2	O75787	350 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	CDK14	O94921	469 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	OR1E1	P30953	314 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ETFB	P38117	255 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	SLC7A2	P52569	658 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	NR1H2	P55055	460 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	IKBKE	Q14164	716 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	GEN1	Q17RS7	908 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	SPATS1	Q496A3	300 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	MIER2	Q8N344	545 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	OR4L1	Q8NH43	312 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		18.4	■□□□□ 0.54

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