RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561726.1

TNRC6A-208, Transcript of trinucleotide repeat containing 6A, humanhuman

TSL 4

Gene TNRC6A, Length 543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6A-208ENST00000561726 HDAC11Q96DB2 347 aa3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 GAD1Q99259 594 aa3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 PAFAH2Q99487 392 aa3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 ZSWIM1Q9BR11 485 aa3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 MRI1Q9BV20 369 aa3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 MECRQ9BV79 373 aa3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 NUP85Q9BW27 656 aa3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 CARD6Q9BX69 1037 aa3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 SLC25A32Q9H2D1 315 aa3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa3.5□□□□□ -1.85
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TNRC6A-208ENST00000561726 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 HPS4Q9NQG7 708 aa3.5□□□□□ -1.85
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TNRC6A-208ENST00000561726 CENPMQ9NSP4 180 aa3.5□□□□□ -1.85
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TNRC6A-208ENST00000561726 TRPC4Q9UBN4 977 aa3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 CDH22Q9UJ99 828 aa3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 PRDM4Q9UKN5 801 aa3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 PSME2Q9UL46 239 aa3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 NFU1Q9UMS0 254 aa3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 NENFQ9UMX5 172 aa3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 SLC8A2Q9UPR5 921 aa3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 CDYLQ9Y232 598 aa3.5□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 HPSEQ9Y251 543 aa3.5□□□□□ -1.85
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TNRC6A-208ENST00000561726 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa3.5□□□□□ -1.85
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TNRC6A-208ENST00000561726 LOC100509620A0A075B734 347 aa3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 A0A1W2PQM1 296 aa3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 HTR3EA5X5Y0 456 aa3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 OOEPA6NGQ2 149 aa3.49□□□□□ -1.85
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TNRC6A-208ENST00000561726 A6NL46 340 aa3.49□□□□□ -1.85
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TNRC6A-208ENST00000561726 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 FAM90A22PA8MWA6 464 aa3.49□□□□□ -1.85
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TNRC6A-208ENST00000561726 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 H0YIN7 160 aa3.49□□□□□ -1.85
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TNRC6A-208ENST00000561726 DHHO43323 396 aa3.49□□□□□ -1.85
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TNRC6A-208ENST00000561726 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
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TNRC6A-208ENST00000561726 CDKL5O76039 1030 aa3.49□□□□□ -1.85
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TNRC6A-208ENST00000561726 CER1O95813 267 aa3.49□□□□□ -1.85
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TNRC6A-208ENST00000561726 RAP2AP10114 183 aa3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 EPORP19235 508 aa3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 AHCYP23526 432 aa3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 CCR1P32246 355 aa3.49□□□□□ -1.85
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TNRC6A-208ENST00000561726 PNPLA4P41247 253 aa3.49□□□□□ -1.85
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TNRC6A-208ENST00000561726 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 VPS41P49754 854 aa3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 RAB28P51157 221 aa3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 PMP22Q01453 160 aa3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
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TNRC6A-208ENST00000561726 SPDYCQ5MJ68 293 aa3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 ATAD3BQ5T9A4 648 aa3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 HMBOX1Q6NT76 420 aa3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 RRM2BQ7LG56 351 aa3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 TAS2R42Q7RTR8 314 aa3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 RD3Q7Z3Z2 195 aa3.49□□□□□ -1.85
TNRC6A-208ENST00000561726 TRABD2AQ86V40 505 aa3.49□□□□□ -1.85
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