RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TNMD	Q9H2S6	317 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF302	Q9NR11	478 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	NFU1	Q9UMS0	254 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934		Q9Y3F1	56 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	MCM3AP	O60318	1980 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	SYCE3	A1L190	88 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934		E7EVH7	732 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	PRY	O14603	147 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	PGK1	P00558	417 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	LGALS2	P05162	132 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	MMP3	P08254	477 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	AKR1A1	P14550	325 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	CYP11B2	P19099	503 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	MATN1	P21941	496 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	MUT	P22033	750 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	MARK3	P27448	753 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	SERPINA4	P29622	427 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	GRK5	P34947	590 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	TUBA4A	P68366	448 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	GIT2	Q14161	759 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	PPTC7	Q8NI37	304 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	CPT1B	Q92523	772 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	KAT2B	Q92831	832 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	CUEDC2	Q9H467	287 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	MGAM	O43451	1857 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	KLRC4	O43908	158 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	FAM155B	O75949	473 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF286B	P0CG31	522 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	ARL4C	P56559	192 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	FOXL2	P58012	376 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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