RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	LIPI	Q6XZB0	460 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	GATA6	Q92908	595 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	AGAP3	Q96P47	875 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	FCRL5	Q96RD9	977 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	LYSMD1	Q96S90	227 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	GPR27	Q9NS67	375 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	ENC1	O14682	589 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	PRL	P01236	227 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	PDHA1	P08559	390 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	DGKA	P23743	735 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	CD86	P42081	329 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	PFN3	P60673	137 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	ARHGEF7	Q14155	803 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	PTK2B	Q14289	1009 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	FZD2	Q14332	565 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	LRRC14	Q15048	493 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	PID1	Q7Z2X4	250 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	NLRP8	Q86W28	1048 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	CAPN8	A6NHC0	703 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	TRIM38	O00635	465 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	SIGLEC6	O43699	453 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	PIAS2	O75928	621 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	PROS1	P07225	676 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	GIMD1	P0DJR0	217 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	TEAD1	P28347	426 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	RBL1	P28749	1068 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	IGFALS	P35858	605 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	MPP3	Q13368	585 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	MTM1	Q13496	603 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	IHH	Q14623	411 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	ST3GAL2	Q16842	350 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	AADACL2	Q6P093	401 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	DHRS13	Q6UX07	377 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF567	Q8N184	647 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	COQ10A	Q96MF6	247 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	TLR10	Q9BXR5	811 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	KLF15	Q9UIH9	416 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	CHKB	Q9Y259	395 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RBM23-231	ENST00000557549	IGF2R	P11717	2491 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	USP24	Q9UPU5	2620 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	C5orf60	A6NFR6	353 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549		A8MX80	341 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	FFAR2	O15552	330 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	ANXA9	O76027	345 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	PYGL	P06737	847 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	HNF1B	P35680	557 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	CLDN6	P56747	220 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	CDK18	Q07002	472 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	CNGA3	Q16281	694 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RBM23-231	ENST00000557549	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		12.33	□□□□□ -0.44

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