RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555573.5

KTN1-223, Transcript of kinectin 1, human

TSL 2 BASIC

Gene KTN1, Length 1,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KTN1-223	ENST00000555573	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	C1orf226	A1L170	272 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	SOCS2	O14508	198 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	TIMM23	O14925	209 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	ITM2A	O43736	263 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	STARD3NL	O95772	234 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	FTCD	O95954	541 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	PSG1	P11464	419 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	HOXB2	P14652	356 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	AKR1B1	P15121	316 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	TRIB2	Q92519	343 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	SGCD	Q92629	289 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573		B4DLN1	442 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	MOSPD3	O75425	235 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	BEST1	O76090	585 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	SOX30	O94993	753 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	CAMP	P49913	170 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	NAB2	Q15742	525 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	KRT24	Q2M2I5	525 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	VCY	O14598	125 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	RGS14	O43566	566 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	G6PD	P11413	515 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	CD58	P19256	250 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	GPT	P24298	496 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	STK4	Q13043	487 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	NEDD9	Q14511	834 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	SHF	Q7M4L6	423 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	PIM3	Q86V86	326 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	OR2A14	Q96R47	310 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	NDST4	Q9H3R1	872 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573		A0A1B0GVT2	93 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	TPPP	O94811	219 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	TUBB	P07437	444 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	NAGA	P17050	411 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	BECN1	Q14457	450 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KTN1-223	ENST00000555573	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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